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微生物分类鉴定中和种相关的几个概念,1.微生物分类单位,TaxonomyDomain(域)Kingdom（界）Phylum(pl:Phyla)（门）Class（纲）Order（目）Family（科）Genus(pl:Genera)（属）Species(pl:Species)（种）,2.种（species）的概念最基本的分类单位，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系及其接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总和Acollectionofmicrobialstrainsthatsharemanypropertiesanddiffersignificantlyfromothergroupsofstrains.种是抽象的概念,模式种（typespecies）在微生物中，一个种只能用该种内一个典型菌株来作为具体标本，这一典型菌株就是该种的模式种模式种必需是一个种的具体活标本，是该菌种的活培养物，它保持着纯培养状态，在形状上必需与原初描述密切相符模式种可用多种方式指定，如可由原始作者指定，如果原始菌株已经丧失，可再提出一个新的模式种Typestrains(模式种)作为鉴定未知种的参考,3.新种权威性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分类并鉴定过的微生物按法规命名发表时，应在其学名后附“sp.nov”或“nov.sp.”是speciesnova的缩写在新种发表前，其模式菌株的培养物就应该存放在一个永久性的菌种保藏机构中，并允许人们能得到现代分类学上规定种内菌株DNA同源性70%16SrDNA序列同源性低于97%,4.变种（variety,var.）：从自然界分离到的微生物纯种，如果与典型种之间存在某些特征的差异，而这些特征又是稳定遗传的，可将这一纯种称为典型种的变种如枯草芽孢杆菌黑色变种Bacillussubtilisvar.niger1976年后一般不在使用变种，实际上是亚种,5.亚种（subspecies,subsp.Ssp.）进一步分种时所用的单位，一般指除某一明显稳定的特征外，其余鉴定特征都与模式种相同的种如金黄色葡萄球菌厌氧亚种Staphylococcusaureussubsp.anaerobius,6.型（type）自然界中存在的差异较小的同种微生物的不同类型结核分枝杆菌依其寄主的不同可分为人型、牛型和禽型肺炎链球菌的I型II型和III型菌株不同血清型等还有形态型（morphotype），生物型（biotype），生理型（physiologicaltype），化学型（chemotype），溶菌型（lysotype），致病型（pathotype）等,7.菌株（strain）任何由一个独立的单细胞繁殖而成的纯种培养物及其一切后代，一种微生物的不同来源的纯培养物均可称该菌种的一个菌株，菌株强调的是遗传型纯的谱系大肠杆菌的两个菌株EscherichiacoliB；EscherichiacoliK12FEscherichiacoliK12S；EscherichiacoliJM109Aspergillusniger3758菌株是实际应用的基本单位，看的见，摸的着,8.学名一个菌种的科学名称，用拉丁词或拉丁化的词组成，在出版物中排列成斜体，书写或打字时在学名之下划一横线表示斜体林奈双名法：属名+种名，属名词首大写，种加词词首小写出现在分类学文献中的学名，在两者后还要加上首次定名人（用括号）、现丁名人和现定名年份在一般使用时这些可以省略,Escherichiacoli(Migula)CastellanietChalmers1919Bacillussubtilis(Ehrenberg)Cohn1872Mycobacteriumtuberculosis(Zopf)LehmannetNewmann1896ClostridiumacetobutylicumMcCoy,Fred,PetersonetHastings1926StaphylococcusaureusRosenbach1884Pseudomonasaeruginosa(Schroeter)Migula1920,种名的加词代表一个种的次要特征，由拉丁词、希腊词或拉丁化的外来词组成字首小写形容词或名词实际中，属名已确定，种名未定，其种的加词暂用“sp.”表示，书写时正体Bacillussp.一个尚未鉴定到种名的枯草芽孢杆菌Bacillusspp.Spp.是species复数的简写，表示一批尚未鉴定到种名的枯草芽孢杆菌，或若干枯草芽孢杆菌,当文章中前面已经出现过某学名时，后面的可将其属名缩写为1-3个字母Escherichiacoli可缩写为E.coliStaphylococcusaureus可缩写为S.aureus,三名法当该种是一个亚种、变种时，使用三名法学名+种的加词+（subsp.或var.）+亚种（或变种）的加词Staphylococcusaureussubsp.anaerobius,9.俗名普通的、通俗的、地区性的名字，具有简明和大众化的优点，但往往涵义不够确切，使用范围局限结核杆菌：结核分枝杆菌（Mycobacteriumtuberculosis）绿脓杆菌：铜绿假单胞菌（Pseudomonasaeruginosa）白色念珠菌：白色假丝酵母（Candidaalbicans）金葡菌：金黄色葡萄球菌（Staphylocuoccusaureus）丙丁菌：丙酮丁醇梭菌（Clostridiumacetobutylicum）红色面包霉：粗糙脉孢菌（Neurosporacrassa）,思考题:比较种和菌株两个概念如何确定一个菌株是新种,
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