自养微生物的生物氧化课件

,单击此处编辑母版标题样式,实用文档,*,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,实用文档,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,实用文档,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,实用文档,*,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,实用文档,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,实用文档,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,实用文档,*,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,实用文档,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,实用文档,自养微生物的生物氧化,自养微生物的生物氧化,营养物质在生物体内经氧化分解，最终生成CO,2,和 H,2,O，并释放能量的过程称,生物氧化,。,生物氧化的概念,营养物质在生物体内经氧化分解，最终生成CO2 和 H2O，并,生物氧化与体外氧化的相同点,生物氧化中物质的氧化方式有加氧、脱氢、失电子，遵循氧化还原反应的一般规律。,物质在体内外氧化时所消耗的氧量、最终产物（CO,2,，H,2,O）和释放能量均相同。,生物氧化与体外氧化的相同点生物氧化中物质的氧化方式有加氧、脱,是在细胞内温和的环境中由酶催化进行的，能量是逐步释放的，并储存于ATP中。,代谢物脱下的氢与氧结合产生H,2,O，有机酸脱羧产生CO,2,。,生物氧化与体外氧化的不同点,生物氧化,体外氧化,能量是突然释放的。,CO,2,、H,2,O由物质中的碳和氢直接与氧结合生成。,是在细胞内温和的环境中由酶催化进行的，能量是逐步释放的，并储,自养和异养生成ATP的氧化体系,The Oxidation System of ATP Producing,自养和异养生成ATP的氧化体系The Oxidation,代谢物脱下的成对氢原子（2H）通过多种酶和辅酶所催化的连锁反应逐步传递，最终与氧结合生成水，这一系列酶和辅酶称为,呼吸链(respiratory chain),又称,电子传递链(electron transfer chain)。,组成,递氢体和电子传递体（2H,2H,+,+ 2e）,呼吸链,呼吸链,一异养微生物的生物氧化,呼吸作用,呼吸作用与发酵作用的根本区别：,电子载体不是将电子直接传递给底物降解的中间产物，而是交给电子传递系统，逐步释放出能量后再交给最终电子受体。,根据反应中电子受体不同分为两种类型：,有氧呼吸,无氧呼吸,一异养微生物的生物氧化呼吸作用,呼吸作用,）有氧呼吸,以分子氧为最终受体的生物氧化,除糖酵解过程外，还包括三羧酸循环和电子传递链两部分反应,C,6,H,12,O,6,+6O,2,=6CO,2,+6H,2,O,发酵面食的制作就即利用了微生物的有氧呼吸,呼吸作用）有氧呼吸,）无氧呼吸,以无机物为最终电子受体的生物氧化过程,化合物氧化脱下的氢和电子经呼吸链传递，最终交给无机氧化物NO,3,、NO,2,、SO,4,或CO,2,的过程。,无氧呼吸也需要细胞色素等电子传递体,在能量的分级释放中常伴随磷酸化作用,也能产生较多的能量(少于有氧呼吸),鬼火的产生:,磷酸盐 磷化氢（PH3）,）无氧呼吸,二、自养微生物的生物氧化,1、化能自养微生物的生物氧化,2、光合微生物,3、自养微生物能量产生与转换,4、自养微生物的能量释放即耗能代谢,二、自养微生物的生物氧化1、化能自养微生物的生物氧化,1、化能自养微生物的生物氧化,CO,2,为主要或唯一碳源，以还原态无机化合物（NH,4,+,、NO,2,-,、H,2,S、S、H和Fe,2,+,等）的生物氧化获得能量和还原力H的微生物称为化能自养微生物。,硝化细菌,硫细菌,铁细菌,氢细菌,1、化能自养微生物的生物氧化,化能自养微生物的生物氧化,1、 氨的氧化,NH,3,、亚硝酸（NO,2,-,）等无机氮化物可以被某些化能自养细菌用作能源。,亚硝化细菌：将氨氧化为亚硝酸并获得能量,硝化细菌：将亚硝氧化为硝酸并获得能量,这两类细菌往往伴生在一起，在它们的共同作用下将铵盐氧化成硝酸盐，避免亚硝酸积累所产生的毒害作用。,这类细菌在自然界的氮素循环中也起者重要的作用，在自然界中分布非常广泛。,化能自养微生物的生物氧化1、 氨的氧化,NH,3,、NO,2,-,的氧化还原电势均比较高，以氧为电子受体进行氧化时产生的能量较少，而且进行合成代谢所需要的还原力需消耗ATP进行电子的逆呼吸链传递来产生，因此这类细菌生长缓慢，平均代时在10h以上。,NH3、NO2-的氧化还原电势均比较高，以氧为电子受体进行氧,2、 硫的氧化,硫细菌（sulfur bacteria）能够利用一种或多种还原态或部分还原态的硫化合物（包括硫化物、元素硫、硫代硫酸盐、多硫酸盐和亚硫酸盐）作能源。,2、 硫的氧化,硫细菌在进行还原态硫物质的氧化时会产酸（主要是硫酸），因此它们的生长会显著地导致环境的pH下降，有些硫细菌可以在很酸的环境，例如在pH低于1的环境中生长。,硫细菌在进行还原态硫物质的氧化时会产酸（主要是硫酸），因此它,3、铁的氧化,从亚铁到高铁状态的铁氧化，对于少数细菌来说也是一种产能反应，但从这种氧化中只有少量的能量可以被利用。因此该菌的生长会导致形成大量的Fe,3+,（Fe(OH),3,）。,以嗜酸性的氧化亚铁硫杆菌为例：,3、铁的氧化,亚铁（Fe,2+,）只有在酸性条件（pH低于3.0）下才能保持可溶解性和化学稳定；,当pH大于4-5，亚铁（Fe,2+,）很容易被氧气氧化成为高价铁（Fe,3+,）；,这就很好的解释了氧化亚铁硫杆菌（,Thiobacillus ferrooxidans,）为什么要在酸性环境下生活？,亚铁（Fe2+）只有在酸性条件（pH低于3.0）下才能保持可,3、铁的氧化,氧化亚铁硫杆菌（,Thiobacillus ferrooxidans,）,在富含FeS,2,的煤矿中繁殖，产生大量的硫酸,和Fe(OH),3,，从而造成严重的环境污染。,它的生长只需要FeS,2,及空气中的O,2,和CO,2,，因此,要防止其破坏性大量繁殖的唯一可行的方法是封,闭矿山，使环境恢复到原来的无氧状态。,3、铁的氧化 氧化亚铁硫杆菌（Thiobacillus fe,4、 氢的氧化,很多细菌能通过对氢的氧化获得生长所需要的能量。,能以氢为电子供体，以O,2,为电子受体，以CO,2,为唯一碳源进行生长的细菌被称为氢细菌,氢细菌都是一些呈革兰氏阴性的兼性化能自养菌。它们能利用分子氢氧化产生的能量同化CO,2 .,4、 氢的氧化,化能自养微生物以无机物作为能源，产能效率低，生长慢。但从生态学角度看，它们所利用的能源物质是一般异养生物所不能利用的，因此它们与产能效率高、生长快的异养微生物之间并不存在生存竞争,。,化能自养微生物以无机物作为能源，产能效率低，生长慢。但从生态,二自养微生物的生物氧化,化能无机营养型：,从无机物的氧化获得能量,以无机物为电子供体,这些微生物一般也能以CO,2,为唯一或主要碳源合成细胞物质,自养微生物,从对无机物的生物氧化过程中获得生长所,需要能量的微生物一般都是：,化能无机自养型微生物,二自养微生物的生物氧化化能无机营养型：从无机物的氧化获得能,复杂分子,（有机物）,分解代谢,合成代谢,简单小分子,ATP,H,自养微生物的合成代谢：,将CO,2,先还原成CH,2,O水平的简单有机物，然后再合成复杂的细胞成分,化能异养微生物：,ATP和还原力均来自对有机物的生物氧化,化能自养微生物：,无机物氧化过程中通过氧化磷酸化产生ATP,如果作为电子供体的无机物的氧化还原电位足够低，也在,氧化磷酸化的过程中产生还原力，但大多数情况下都需要,通过电子的逆向传递，以消耗ATP为代价获得还原力。,复杂分子分解代谢合成代谢简单小分子ATPH自养微生物的合,2、光合微生物,光合细菌类群,细菌光合色素,细菌光合作用,2、光合微生物,光合作用实质是通过光合磷酸化将光能转化为化学能，以用于从二氧化碳合成细胞物质。,光合作用实质是通过光合磷酸化将光能转化为化学能，以用于从二氧,产氧光合细菌,蓝细菌,紫色细菌和绿色细菌,不产氧光合细菌,原绿植物纲,产氧光合细菌,细菌光合色素,1.叶绿素或细菌叶绿素,2.类胡萝卜素,3.藻胆素,细菌光合色素,细菌光合作用,依靠菌绿素的光合作用,依靠叶绿素的光合作用,依靠菌视紫红质的光合作,用,细菌光合作用,光合磷酸化,光合磷酸化是指光能转变为化学能的过程。,光合磷酸化光合磷酸化是指光能转变为化学能的过程。,3、自养微生物的能量产生与转换,化能营养型,光能营养型,底物水平磷酸化,氧化磷酸化,通过光合磷酸化将光能转变为,化学能储存于ATP中,3、自养微生物的能量产生与转换化能营养型光能营养型底物水平磷,氧化磷酸化,体内ATP生成的方式：,氧化磷酸化 (oxidative phosphorylation),是指在呼吸链电子传递过程中偶联ADP磷酸化，生成ATP，又称为,偶联磷酸化,。,氧化磷酸化体内ATP生成的方式：,（二） 氧化磷酸化的偶联机制,1. 化学渗透假说(chemiosmotic hypothesis),电子经呼吸链传递时，可将质子（H,+,）从线粒体内膜的基质侧泵到内膜胞浆侧，产生膜内外质子电化学梯度储存能量。当质子顺浓度梯度回流时驱动ADP与Pi生成ATP。,（二） 氧化磷酸化的偶联机制1. 化学渗透假说(chemio,1、底物水平磷酸化（substrate level phosphorylation）,物质在生物氧化过程中，常生成一些含有高能键的化合物，,而这些化合物可直接偶联ATP或GTP的合成。,底物水平磷酸化 (substrate level phos-phorylation),是底物分子内部能量重新分布，生成高能键，使ADP磷酸化生成ATP的过程。,1、底物水平磷酸化（substrate level phos,草酰乙酸,柠檬酸,异柠檬酸,草酰琥珀酸,- 酮戊二酸,琥珀酰辅酶A,琥珀酸,延胡索酸,苹果酸,丙酮酸,乙酰辅酶A,GTP,GDP+Pi,三羧酸,循 环,底物水平磷酸,化发生在呼吸,作用过程中,草酰乙酸柠檬酸异柠檬酸草酰琥珀酸- 酮戊二酸琥珀酰辅酶A琥,ATP的生成和利用,ATP的生成和利用,光合磷酸化,光能转变为化学能的过程：当叶绿素分子吸收光量子时，叶绿素性质上即被激活，导致其释放一个电子而被氧化，释放出的电子在电子传递系统中的传递过程中逐步释放能量，这就是光合磷酸化的基本动力。,光合磷酸化和氧化磷酸化一样都是通过电子传递系统产生ATP,光合磷酸化,光能营养型,生物,产氧,不产氧,真核生物：藻类及其它绿色植物,原核生物：蓝细菌,（仅原核生物有）：光合细菌,光能营养型产氧不产氧真核生物：藻类及其它绿色植物原核生物：蓝,3、光合磷酸化（photophosphorylation）,细菌叶绿素具有和高等植物中的叶绿素相类似的化学结构，二者的,区别在于侧链基团的不同，以及由此而导致的光吸收特性的差异。,这两幅图是叶绿素a和细菌叶绿素a的结构，两者均是镁-胆色烷。两分子除了绿色和黄色标记部分外均相同。中间的镁原子以蓝色标记展出。,3、光合磷酸化（photophosphorylation）细,（a）绿色莱茵衣藻细胞的吸收谱。在680和430nm的峰取决于叶绿素a，在480nm的峰取决于类胡萝卜素。,(b)叶绿素紫色细菌红假单胞菌细胞的吸收谱。在870,800,590,360nm的峰取决于细菌叶绿素a，在525,475nm的峰取决于类胡萝卜素。,（a）绿色莱茵衣藻细胞的吸收谱。在680和430nm的峰取决,光合磷酸化,光合磷酸化分为环式光合磷酸化、非环式光合磷酸化、紫膜光合磷酸化,光合磷酸化光合磷酸化分为环式光合磷酸化、非环式光合磷酸化、紫,3、光合磷酸化,（1）环式光合磷酸化,光合细菌主要通过环式光合磷酸化作用产生ATP,在光能的驱动下，电子从菌绿素分子上逐出后，通过类似呼吸链的循环，又回到菌绿素，其间产生了ATP；,不是利用H,2,O，而是利用还原态的H,2,、 H,2,S等作为氢供体，进行不产氧的光合作用,电子传递的过程中造成了质子的跨膜移动，为ATP的合成提供了能量。,3、光合磷酸化（1）环式光合磷酸化,细菌叶绿素吸收光量子而被激活释放出高能电子，此时细菌叶绿素分子即带有正电荷。释放出的高能电子依次通过醌铁蛋白，辅酶Q，细胞色素b和细胞色素c组成的电子传递链，再返回到带正电的细菌叶绿素分子，使叶绿素分子回复到原来的状态。,细菌叶绿素吸收光量子而被激活释放出高能电子，此时细菌叶绿素分,（2）非环式光合磷酸化,这是各种绿色植物、藻类和蓝细菌所共有的利用光能产生ATP的磷酸化反应,非环式光合磷酸化的反应式：,2NADP,+,2ADP2Pi2H,2,O2NADPH2H,+,2ATPO,2,（2）非环式光合磷酸化非环式光合磷酸化的反应式：,非环式光合磷酸化特点,电子的传递途径属非循环式的；,在有氧条件下进行；,有两个光合系统，其中的色素系统（含叶绿素a）可以利用红光，色素系统（含叶绿素b）可利用蓝光；,反应中同时有ATP、还原力H（产自系统）和O,2,产生；,非环式光合磷酸化特点,非环式光合磷酸化,过程：,在,光合系统,中叶绿素分子P,700,吸收光子后被激活，释放一个高能电子并传递给铁氧还蛋白。铁氧还蛋白在还原酶作用下将NADP,+,还原为NADPH。在,光合系统,中叶绿素分组P,680,吸收光子后释放出高能电子。然后传递给辅酶Q，再传递给,光合系统,，使P,700,还原。而P,680,失去的电子靠水的光解产生电子来补充。高能电子从辅酶Q到,光合系统,的过程中，可推动ATP的合成。,非环式光合磷酸化过程：在光合系统中叶绿素分子P700吸收光,（）紫膜光合磷酸化,一种只有嗜盐菌才有的，无叶绿素或细菌叶绿素参与的独特的光合作用。紫膜的光合磷酸化是迄今所知道的最简单的光合磷酸化反应,紫膜中的菌视紫素在光量子的驱动下，具有质子泵的作用，这时它将产生的H,+,推出细胞膜外，使紫膜内外造成一个质子梯度差,（）紫膜光合磷酸化,3、光合磷酸化（photophosphorylation）,嗜盐菌紫膜的光合作用,嗜盐菌,细胞膜,红色部分（红膜）,紫色部分（紫膜）,主要含细胞色素和黄素蛋白等用于氧化磷酸化的呼吸链载体,在膜上呈斑片状（直径约0.5 mm）独立分布，其总面积约占,细胞膜的一半，主要由细菌视紫红质组成。,实验发现，在波长为550-600 nm的光照下，嗜盐菌ATP的合成速率,最高，而这一波长范围恰好与细菌视紫红质的吸收光谱相一致。,3、光合磷酸化（photophosphorylation）嗜,四种生理类型的微生物在不同光照和氧下的ATP合成,四种生理类型的微生物在不同光照和氧下的ATP合成,4、自养微生物的能量释放即耗能代谢,（）,的固定,（）生物固氮,4、自养微生物的能量释放即耗能代谢,的固定,的固定：将空气中,的同化成细胞物质的过程。,的固定的固定：将空气中的同化成细胞物质的过,自养微生物对CO,2,的固定,卡尔文循环（Calvin cycle）,还原性三羧酸循环途径,厌氧乙酰-CoA途径,羟基丙酸途径,自养微生物对CO2的固定,卡尔文循环（Calvin cycle）的三个阶段,羧化反应,3个核酮糖-1,5-二磷酸通过核酮糖二磷酸羧化酶将3个CO,2,固定,并转变成6个3-磷酸甘油酸分子。,还原反应,3-磷酸甘油酸还原成3-磷酸甘油醛（通过逆向EMP途径产生）。,CO,2,受体的再生,1个3-磷酸甘油醛通过EMP途径的逆转形成葡萄糖，其余5个分子经复杂的反应再生出3个核酮糖-1,5-二磷酸分子。,卡尔文循环（Calvin cycle）的三个阶段,还原性三羧酸循环途径,4C,还原性三羧酸循环途径4C,厌氧乙酰-CoA途径,厌氧乙酰-CoA途径,羟基丙酸途径,羟基丙酸途径,生物固氮,1,、固氮微生物,最早发现的固氮微生物是,共生的根瘤菌属,和,自生的固氮菌属,，它们分别于,1886,年和,1901,年由荷兰学者,M.Beijerinck,所分离。目前已知所有固氮微生物即固氮菌都属于原核生物和古生菌类，在分类上隶属于,固氮菌科,、,根瘤菌科,、,红螺菌目,、,甲基球菌科,、,蓝细菌,以及,芽孢杆菌属,和,梭菌属,中的部分菌种。自,1886,年首次分离共生固氮的根瘤菌起，至今已发现的固氮微生物多达,80,余属,（,1992,年）。从其生态类型分，固氮菌可分,3,类：,生物固氮1、固氮微生物,1,、自生固氮菌,指一类不依赖与它种生物共生而能独立进行固氮的微生物。,2,、共生固氮菌,指必须与它种生物共生在一起时才能进行固氮的微生物。,3,、联合固氮菌,指必须生活在植物根际、叶面或动物肠道等处才能进行固氮的微生物。,1、自生固氮菌,固氮微生物,自生固氮菌,好氧自生固氮菌,固氮菌属,巴氏芽孢梭菌,厌氧自生固氮菌,兼性厌氧自生固氮菌,联合固氮菌,根际、叶面、动物肠道等处的固氮微生物,共生固氮菌,满江红鱼腥藻,根瘤,植物,豆科植物,地衣,固氮微生物自生固氮菌好氧自生固氮菌固氮菌属,、生物固氮,生命所需氮的最终来源是无机氮。而目前仅发现一些特殊类群的原核生物能将分子氮转化为氨。微生物将氮还原为氨的过程称为生物固氮。,某些细菌、放线菌、蓝细菌；,尚未发现真核生物具有固氮作用；,、生物固氮,固氮的生化机制,生物固氮是一个具有重大理论意义和实用价值的生化反应过程。,1960,年，,J.E.Carnahan,等人从巴氏梭菌中提取到具有固氮活性的无细胞抽提液，并实现了分子氮还原为氨，使生物固氮的研究有了突破性进展。,1,、生物固氮反应的,6,要素,（,1,）,ATP,的供应,固氮的生化机制生物固氮是一个具有重大理论意义和实用价值的生化,（,2,）还原力,H,及其传递载体,H,由低电位势的电子载体铁氧还蛋白或黄素氧还蛋白传递至固氮酶上。,（,3,）固氮酶 固氮酶是一种复合蛋白，由固二氮酶和固二氮酶还原酶两种相互分离的蛋白构成。固二氮酶是一种含铁和钼的蛋白，铁和钼组成一个称为“,FeMoCo”,的辅因子，它是还原,N,2,的活性中心。而固二氮酶还原酶则是一种只含铁的蛋白。某些固氮菌处于不同生长条件下时，还可合成其它不含钼的固氮酶，称作“替补固氮酶”，具有适应在极度缺钼环境下还能正常进行生物固氮的功能。,（,4,）还原底物,N,2,（,5,）镁离子,（,6,）严格的厌氧微环境,（2）还原力H及其传递载体 H由低电位势的电子载体,固氮的生化过程,固氮的过程是一个非常消耗能量的过程，固定1分子的N,2,需消耗12-16分子的ATP和6-8个电子。这种能量和电子变化主要原因是是否考虑固氮酶产H,2,过程，如果不考虑H,2,产生，固氮反应可以写成如下形式,N,2,+6H,+,+6e,-,+12ATP2NH,3,+12ADP+12Pi,如果将H2的因素考虑在内，则表现为另一种形式：,N,2,+8H,+,+8e,-,+16ATP2NH,3,+16ADP+16Pi+H,2,固氮的生化过程固氮的过程是一个非常消耗能量的过程，固定1分子,固氮过程中H,2,的产生是一个耗费能量的过程，实际上，好氧固氮微生物由于存在膜结合的氢化酶循环过程，产生的H,2,直接进行循环氧化后形成ATP进入固氮过程。,固氮过程中H2的产生是一个耗费能量的过程，实际上，好氧固氮微,不同形式的根瘤,不同形式的根瘤,好氧菌固氮酶避免氧害机制,固氮酶的两个蛋白组分对氧是极其敏感的，它们一旦遇氧就很快导致不可逆的失活，例如，固二氮酶还原酶在空气中暴露,45,秒后即丧失一半活性；固二氮酶在空气中的活性半衰期为,10,分钟。不同微生物的固氮酶，对氧的敏感性有很大差别。,大多数固氮微生物都是好氧菌，其生命活动包括生物固氮所需能量都是来自好氧呼吸和非循环光合磷酸化。在它们身上存在着好氧生化反应（呼吸）和厌氧生化反应（固氮）两种矛盾过程。好氧性固氮菌在长期进化过程中，进化出适合不同条件下保护固氮酶免受氧害的机制。,好氧菌固氮酶避免氧害机制固氮酶的两个蛋白组分对氧是极其敏感的,好氧性自生固氮菌的抗氧保护机制,（,1,）,呼吸保护,固氮菌科的菌种能以极强的呼吸作用迅速将周围环境中的氧消耗掉，使细胞周围微环境处于低氧状态，借此保护固氮酶。,（,2,）,构象保护,在高养分压条件下，维涅兰德固氮菌和褐球固氮菌等的固氮酶能形成一个无固氮活性但能防止氧害的特殊构象。构象保护的原因是存在一种耐氧蛋白即铁硫蛋白,，它在高氧条件下可与固氮酶的两个组分形成耐氧的复合物。,好氧性自生固氮菌的抗氧保护机制（1）呼吸保护 固氮菌科的菌,谢谢,谢谢,讨论,什么是光合磷酸化？,光合磷酸化有哪些特点？,讨论什么是光合磷酸化？,