凝固酶阴性葡萄球菌培训课件

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,本文档所提供的信息仅供参考之用，不能作为科学依据，请勿模仿。文档如有不当之处，请联系本人或网站删除。,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,本文档所提供的信息仅供参考之用，不能作为科学依据，请勿模仿。文档如有不当之处，请联系本人或网站删除。,1,、立题依据,凝固酶阴性葡萄球菌（,CoNS,）广泛存在于人体皮肤、黏膜等组织表面，常在血液、痰液、尿液、深静脉置管等各种标本中检出。,文献报道，,1995-1996,年美国,48,个医学中心,2596,份血标本中，,CoNS,的分离率达,32.2%,。,尽管血液等无菌体液培养出,CoNS,临床意义较大，但据报道单次血培养,CoNS,污染的可能性仍高达,85%,。,第一部分 研究背景和意义,1,1、立题依据凝固酶阴性葡萄球菌（CoNS）广泛存在于人体皮肤,近年来由于介入性诊疗操作、免疫抑制剂及广谱抗生素的广泛使用，,CoNS,已成为院内感染的重要病原菌，而且耐药菌株比金黄色葡萄球菌更为多见。,叶联华等报道人工瓣膜术后心内膜炎中，约有,40%-50%,由凝固酶阴性葡萄球菌引起；,2009,年中国,CHINET,细菌耐药监测结果,MRCoNS,检出率平均为,71.7%,大于,MRSA,的,52.7%,。,研究背景和意义,2,近年来由于介入性诊疗操作、免疫抑制剂及广谱抗生素的广泛使用，,CoNS,作为皮肤黏膜定植菌，在越来越多的标本中被分离出来，常常引起临床困惑。其是否能作为感染的病原菌是临床关心的问题。,有鉴于此，,实验室建立对,CoNS,污染菌和致病菌界定的方法十分必要，是临床明确诊断和制定合理治疗方案的重要前提。,研究背景和意义,3,CoNS 作为皮肤黏膜定植菌，在越来越多的标本中被分离出来，,CoNS,致病物质,在,CoNS,感染的发病过程中，细菌先黏附继而形成难以清除的生物膜是其最为重要的致病机制；,其中,CoNS,产生的,多糖胞间黏附素（,polysacchatide intercellular adhesion,，,PIA,）,是细菌生物膜形成聚集阶段所必需的物质，在感染过程中起重要的作用，是鉴定其致病性的物质基础。,Heilmann,等发现,ica,操纵子,对合成,PIA,以及在细菌形成成熟的生物膜中起到非常重要的作用。,研究背景和意义,4,CoNS致病物质在 CoNS 感染的发病过程中，细菌先黏附继,ica,基因结构,ica,基因座定位于细菌染色体，全长,3.4 kb,，包括,icaR,调节基因及串联存在的,icaA,、,icaD,、,icaB,和,icaC,结构基因。,其中，,icaADBC 4,个基因构成一个操纵子，可以通过检测,icaADBC,基因来反映,ica,操纵子的存在。,icaB,不直接参与胞间黏附素的合成,因为重组,icaADC,就能使细胞积聚；,icaA,单独呈现低的,N-,乙酰葡糖胺转移酶活性；,icaC,涉及到把不断合成的多糖物质转运至细胞表面；,生物膜的形成要求,icaD,编码的产物具有最佳活性。,因此,我们选择了,icaD,作为本试验的目的基因片段。,研究背景和意义,5,ica 基因结构ica 基因座定位于细菌染色体，全长 3.4,获得,CoNS,特异的致病性分子标志物；,确立敏感、准确、快速的医院感染相关性,CoNS,特异基因诊断方法；,能够准确鉴定致病性与非致病性,CoNS,。,研究背景和意义,2,、实验目的,6,获得CoNS特异的致病性分子标志物；研究背景和意义 2、实验,研究,CoNS,的生物标志物对该菌在医院获得性感染中的临床微生物学诊断与鉴定，追踪传染源，探索其在医院感染中的确切作用和地位、传播与感染规律，从而对控制传播途径、建立准确有效的防治措施具有重要实际意义和经济价值。,研究背景和意义,3,、临床意义,7,研究CoNS的生物标志物对该菌在医院获得性,阴性对照：表皮葡萄球菌,ATCC12228,，购自中国药品鉴定所，经基因组测序证明其,ica,操纵子缺失；,阳性对照：表皮葡萄球菌,1-97-337,，瑞金医院倪语星教授惠赠，含有完整,ica,操纵子；,待测样本：自,2006,年,1,月至,2007,年,9,月，收集我院临床各科室共,114,例疑是感染性标本。,第二部分 材料和方法,1,、研究对象,8,阴性对照：表皮葡萄球菌ATCC12228，购自中国药品鉴定所,2,、主要试剂,培养基：哥伦比亚琼脂培养基、刚果红琼脂,培养基、,LB,肉汤增菌液。,引物：,SodA,引物,（,5-CCITAYICITAYGAYGCIYTIGARCC-3,及,5-ARRTARTAIGCRTGYTCCCAIACRTC-3,）；,icaD,引物,（,5-AGGCAATA TCCAACGGTAA-3,及,5-GTCACGACCTTTCTTATATT-3,）；,16S rDNA,引物,（,5-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3,及,5-CCGTCAATTCCATTTRAG TTT-3,）。,材料和方法,9,2、主要试剂培养基：哥伦比亚琼脂培养基、刚果红琼脂,3,、主要仪器设备,PCR,仪：,PTC100 PCR,仪，美国,MJ Research Inc.,；,恒压恒流电泳仪、电泳槽：,DF-C,型，北京东方特力科贸中心；,凝胶成像系统：,GDS8000,，美国,UVP Inc.,；,核酸,/,蛋白定量仪：,DU640,，美国,Beckman,；,酶标仪：美国雷杜，深圳组装；,ATB Expression,：法国,bioMrieux Inc,；,生物安全柜：,BSC-1500 B2,，济南鑫贝西生物技术有限公司；,全自动快速微生物培养检测系统：,BacT/ALERT 3D 60,，法国,bioMrieux Inc,；,材料和方法,10,3、主要仪器设备PCR仪：PTC100 PCR仪，美国MJ,4,、实验设计及方法,标本采集,阴、阳性对照,菌种鉴定,PIA,检测,PCR,扩增,icaD,基因,sodA,基因,16SrDNA,序列,生物膜形成实验,DNA,测序、,生物信息学分析,确定特征片段,临床验证,比较分析,材料和方法,11,4、实验设计及方法标本采集阴、阳性对照菌种鉴定PIA检测PC,图,2.1,：,部分样品刚果红试验结果,3,4,1,、刚果红试验,第三部分 结果和讨论,12,图2.1：部分样品刚果红试验结果34 1、刚果红试验第三部,表,2.1:114,例,CoNS,的菌种组成及刚果红试验结果,菌 种,例数,所占比例（）,刚果红试验阳性,刚果红试验,各菌种阳性,率（）,表皮葡萄球菌,47,41.2,18,38.3,溶血葡萄球菌,43,37.7,3,6.98,人葡萄球菌,11,9.65,1,9.09,木糖葡萄球菌,3,2.63,0,沃氏葡萄球菌,2,1.75,0,头状葡萄球菌,3,2.63,1,33.3,中间葡萄球菌,1,0.86,1,100,山羊葡萄球菌,2,1.75,0,缓慢葡萄球菌,合计,2,114,1.75,100,0,24,结果和讨论,13,表2.1:114例CoNS的菌种组成及刚果红试验结果菌,刚果红试验通过培养,48h,后菌落的颜色变化来反映,CoNS,表达多糖胞间黏附素的情况，进而间接地反映其致病性。,114,例样品中刚果红试验阳性率,21.1%,，由于,CoNS,分泌的,PIA,在培养过程中可以丢失，使阳性结果偏低；另外，其方法学本身易于受多种因素影响，比如：蔗糖的浓度、氯化钠和琼脂的浓度、气体条件等，干扰了实验结果的正确性，不能满足临床要求。,结果和讨论,14,刚果红试验通过培养48h后菌落的颜色变化来反映 CoNS 表,2,、,ica D,基因片段的扩增,a,b,c d e f g,2000,1000,500,250,(bp),图,2.2,：部分样品的,icaD,基因片段的,PCR,扩增结果,结果和讨论,15,2、ica D基因片段的扩增 a b,表,2.2:114,例,CoNS,不同菌种,icaD,片段,PCR,扩增的结果,菌 种,例数,所占比例（）,icaD,片段,PCR,阳性结果,PCR,实验,各菌种阳性率（）,表皮葡萄球菌,47,41.2,20,42.6,溶血葡萄球菌,43,37.7,8,18.6,人葡萄球菌,11,9.65,2,18.2,木糖葡萄球菌,3,2.63,0,沃氏葡萄球菌,2,1.75,0,头状葡萄球菌,3,2.6,2,66.7,中间葡萄球菌,1,0.86,1,100,山羊葡萄球菌,2,1.75,0,缓慢葡萄球菌,合计,2,114,1.75,100,0,33,结果和讨论,16,表2.2:114例CoNS不同菌种icaD片段PCR扩增的,结果和讨论,17,结果和讨论17,图,2.3:,部分样品的定性黏附性实验结果,3,、体外黏附性实验,结果和讨论,18,图2.3:部分样品的定性黏附性实验结果 3、体外黏,表,2.4:9,例,icaD,（,+,）菌株,半定量黏附性实验结果,实验分类,实验例数,黏附实验,阳性,黏附实验,阴性,ica D PCR,（），,刚果红（）,6,6,0,ica D PCR,（），,刚果红（,）,3,2,1,合计,9,8,1,结果和讨论,19,表2.4:9例icaD（+）菌株半定量黏附性实验,通过体外半定量黏附实验测得,88.9%,（,8/9,）,icaD,（,+,）菌株是粘附株。,可见以半定量黏附试验结果作为生物膜形成能力的判定标准，,ica,操纵子的存在与,CoNS,粘附及其生物膜形成密切相关。,体外黏附性实验用光吸收原理检测生物膜成分，但生物膜本身的结构会受到破坏；且由于方法比较复杂，需要严格控制实验条件才能获得较好的重复性，不适合临床常规应用。,结果和讨论,20,通过体外半定量黏附实验测得88.9%（8/9）icaD（+,4,、,16S rDNA,及,sodA,基因片段扩增,a,b,c d e,2000,1000,500,100,(bp),图,2.5,：部分样品的,16S rDNA,片段,PCR,扩增结果,结果和讨论,21,4、16S rDNA及sodA基因片段扩增 a,图,2.6,：部分样品的,sodA,片段,PCR,扩增结果,a,b,c d e,2000,1000,500,250,(bp),结果和讨论,22,图2.6：部分样品的sodA 片段PCR 扩增结果,图,7,：部分样品,sodA PCR,扩增产物的测序图谱,结果和讨论,23,图7：部分样品sodA PCR扩增产物的测序图谱 结果和讨,37,例,CoNS,样品进行了,16S rDNA,基因及,sodA,基因片段的,PCR,扩增，电泳检测结果显示全部样品均能准确地扩增出相应的片段，其片段大小分别为,16S rDNA 926bp,及,sodA 482bp,，且均为单一条带；,序列测定表明所有样品,16S rDNA,及,sod A PCR,产物序列均相同，未发现与感染相关的特异性分子序列。,结果和讨论,24,37例CoNS样品进行了16S rDNA基因及sodA基因,ica,操纵子可出现在多种,CoNS,中，临床实验室建立并常规进行,CoNS,致病性分子标志物的检测方法是有意义、有必要的；,通过本实验我们确立了的敏感、准确、快速的医院感染相关性,CoNS,基因诊断新方法，即,ica D,基因扩增方法；,第四部分 结论,25,ica操纵子可出现在多种CoNS中，临床实验室建立并常规进行,结论,本研究首次报道了除表皮葡萄球菌以外的其他种的凝固酶阴性葡萄球菌产生多糖胞间粘附因子的情况；,表皮葡萄球菌在临床,CoNS,中检出最多，是携带,icaD,操纵子的主要菌种，其致病性应引起足够重视；,26,结论本研究首次报道了除表皮葡萄球菌以外的其他种的凝固酶阴性葡,结论,16S rDNA,以及,sod A,基因可作为鉴定,CoNS,的基因标记，但不能用来作为致病性与非致病性凝固酶阴性葡萄球菌的鉴