医学研究中的logistic模型精讲培训ppt课件

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医学研究中的医学研究中的logisticlogistic模模型精讲型精讲医学研究中的医学研究中的logistic模型精模型精讲讲1Logistic模型在医学研究中的地位模型在医学研究中的地位p线性回归是非常经典的回归模型,但不适用于因线性回归是非常经典的回归模型,但不适用于因变量为分类变量的情况变量为分类变量的情况p考虑选择一个在(考虑选择一个在(0,1)之间有)之间有S型曲线的分布,型曲线的分布,如如probit分布、分布、logistic分布等分布等pLogistic分布是最流行的一种分布分布是最流行的一种分布p形成了我们今天熟悉的形成了我们今天熟悉的logistic回归模型回归模型2医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲Logistic模型在医学研究中的地位模型在医学研究中的地位线线性回性回归归是非常是非常经经典的回典的回2Logistic模型在医学研究中的地位模型在医学研究中的地位plogistic回归模型在医学中的主要用途:回归模型在医学中的主要用途:p探索疾病发生的危险因素探索疾病发生的危险因素p验证某危险因素对疾病的效果,校正其它混杂因验证某危险因素对疾病的效果,校正其它混杂因素的影响素的影响p预测某疾病发生的概率预测某疾病发生的概率p评价不同因素水平下的发病风险评价不同因素水平下的发病风险3医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲Logistic模型在医学研究中的地位模型在医学研究中的地位logistic回回归归模模3logistic曲线曲线p常用于描述:常用于描述:p初期增长速度越来越快初期增长速度越来越快p后期增长速度越来越慢后期增长速度越来越慢p最终趋于一个上限值最终趋于一个上限值p反映事物发生、发展、成熟、饱和的整个过程反映事物发生、发展、成熟、饱和的整个过程p例如:人口增长趋势、企业成长模式、物种种群数量的增例如:人口增长趋势、企业成长模式、物种种群数量的增加、细胞的增长、药物浓度在体内的变化等加、细胞的增长、药物浓度在体内的变化等4医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲logistic曲曲线线常用于描述:常用于描述:4医学研究中的医学研究中的logisti4logistic曲线曲线p最简单的最简单的logistic曲线:曲线:5医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲logistic曲曲线线最最简单简单的的logistic曲曲线线:5医学研究医学研究5logistic曲线曲线p常见的常见的logistic曲线(三参数曲线(三参数logistic曲线):曲线):p式中,式中,K、a、b为待估参数为待估参数pK 代表曲线的上限值代表曲线的上限值pa反映了增长速度反映了增长速度pb表示拐点,在这一点增长速度最快,这一点对应表示拐点,在这一点增长速度最快,这一点对应的的y值为值为K/26医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲logistic曲曲线线常常见见的的logistic曲曲线线(三参数(三参数log6logistic曲线曲线p四参数四参数logistic曲线:曲线:p式中,式中,D、C、a、b为待估参数为待估参数pD 代表曲线的上限值代表曲线的上限值pC 代表曲线的下限值代表曲线的下限值pa反映了增长速度反映了增长速度pb表示拐点,在这一点增长速度最快表示拐点,在这一点增长速度最快7医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲logistic曲曲线线四参数四参数logistic曲曲线线:7医学研究中医学研究中7logistic曲线曲线p二参数二参数logistic曲线:曲线:p式中,式中,a、b为待估参数为待估参数pa反映了增长速度反映了增长速度pb表示拐点,在这一点增长速度最快表示拐点,在这一点增长速度最快8医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲logistic曲曲线线二参数二参数logistic曲曲线线:8医学研究中医学研究中8Logistic回归模型回归模型pLogistic回归模型(单因素回归模型(单因素logistic回归模型):回归模型):pp为阳性率,如疾病发生率、死亡率等为阳性率,如疾病发生率、死亡率等p0和和1为待估参数,分别表示模型的截距和斜率为待估参数,分别表示模型的截距和斜率9医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲Logistic回回归归模型模型Logistic回回归归模型(模型(单单因素因素lo9Logistic回归模型回归模型pLogistic回归模型(多因素回归模型(多因素logistic回归模型):回归模型):pp为阳性率,如疾病发生率、死亡率等为阳性率,如疾病发生率、死亡率等p0为待估参数,表示模型的截距为待估参数,表示模型的截距p1、1、m为待估参数,分别表示各自变量为待估参数,分别表示各自变量的斜率的斜率10医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲Logistic回回归归模型模型Logistic回回归归模型(多因素模型(多因素lo10用用logistic曲线拟合剂量反应关系曲线拟合剂量反应关系p剂量反应关系:剂量反应关系:p某药物的生理反应强度对给药量的函数某药物的生理反应强度对给药量的函数p随着药量增加,反应强度增大,但不会无限增大,随着药量增加,反应强度增大,但不会无限增大,而是有一个上限值而是有一个上限值p不少剂量反应关系都呈不少剂量反应关系都呈S型曲线,可用型曲线,可用logistic曲线曲线来描述来描述11医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合剂剂量反量反应应关系关系剂剂量反量反应应关系:关系:11医学医学11用用logistic曲线拟合剂量反应关系曲线拟合剂量反应关系p例例1:某实验室进行小鼠的药物毒性实验,下面数:某实验室进行小鼠的药物毒性实验,下面数据为不同剂量下的小鼠死亡率。据为不同剂量下的小鼠死亡率。剂量剂量(mg/kg)死亡率死亡率30.7038.40.2480.35600.8750.9512医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合剂剂量反量反应应关系例关系例1:某:某实验实验室室进进行小鼠行小鼠12用用logistic曲线拟合剂量反应关系曲线拟合剂量反应关系p该实验的结果为死亡率,因此最高为该实验的结果为死亡率,因此最高为1p可以考虑二参数可以考虑二参数logistic曲线拟合曲线拟合13医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合剂剂量反量反应应关系关系13医学研究中的医学研究中的log13用用logistic曲线拟合剂量反应关系曲线拟合剂量反应关系14医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合剂剂量反量反应应关系关系14医学研究中的医学研究中的log14用用logistic曲线拟合剂量反应关系曲线拟合剂量反应关系15医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合剂剂量反量反应应关系关系15医学研究中的医学研究中的log15用用logistic曲线拟合剂量反应关系曲线拟合剂量反应关系p拟合模型:拟合模型:p死亡率以死亡率以0.14的速率增长的速率增长p剂量在剂量在51.26时死亡率的增长时死亡率的增长速度达到高峰,以后死亡率速度达到高峰,以后死亡率增长速度开始下降增长速度开始下降p半数致死剂量为半数致死剂量为51.26(95%CI:48.96-53.56)16医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合剂剂量反量反应应关系关系拟拟合模型:合模型:16医学研究医学研究16用用logistic曲线拟合剂量反应关系曲线拟合剂量反应关系p反推:反推:p在什么剂量下死亡率达到在什么剂量下死亡率达到50%?17医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合剂剂量反量反应应关系反推:关系反推:17医学研究中的医学研究中的17用用logistic曲线拟合剂量反应关系曲线拟合剂量反应关系pLogistic曲线与直线拟合的比较曲线与直线拟合的比较logistic曲线曲线直线拟合直线拟合18医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合剂剂量反量反应应关系关系Logistic曲曲线线与与18用用logistic曲线拟合曲线拟合SARS发展趋势发展趋势p例例2:2003年年SARS在香港的感染人数,在香港的感染人数,t=0表示表示2003年年3月月17日。日。天数天数病例数病例数0955222124701980026110833135840152747162154167461171068172475173981175087175519医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合SARS发发展展趋势趋势例例2:2003年年S19用用logistic曲线拟合曲线拟合SARS发展趋势发展趋势p感染人数无上限,但有下限(感染人数无上限,但有下限(0),考虑三参数模型),考虑三参数模型20医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合SARS发发展展趋势趋势20医学研究中的医学研究中的l20用用logistic曲线拟合曲线拟合SARS发展趋势发展趋势p拟合模型:拟合模型:p感染人数以感染人数以0.11的速度增的速度增长长p在第在第21天时感染速率最高,天时感染速率最高,从从21以后感染速度放慢以后感染速度放慢p最高感染人数约为最高感染人数约为1732人人21医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合SARS发发展展趋势拟趋势拟合模型:合模型:21医学医学21用用logistic曲线拟合曲线拟合SARS发展趋势发展趋势pLogistic曲线与指数曲线拟合的比较曲线与指数曲线拟合的比较logistic曲线曲线指数曲线指数曲线22医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合SARS发发展展趋势趋势Logistic曲曲22用用logistic曲线拟合曲线拟合SARS发展趋势发展趋势p预测模拟(预测刻画器)预测模拟(预测刻画器)23医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合SARS发发展展趋势预测趋势预测模模拟拟(预测预测刻画刻画23用用logistic曲线拟合曲线拟合SARS发展趋势发展趋势p反推预测:反推预测:p根据根据logistic曲线拟合结果,什么时候病例突破曲线拟合结果,什么时候病例突破1000?24医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic曲曲线拟线拟合合SARS发发展展趋势趋势反推反推预测预测:24医学医学24用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p探索疾病的危险因素是探索疾病的危险因素是logistic回归的一个重要作用回归的一个重要作用p病因研究一般可分为探索性研究和证实性研究病因研究一般可分为探索性研究和证实性研究p探索性研究主要用于对疾病发生的影响因素不确定,作为探索性研究主要用于对疾病发生的影响因素不确定,作为疾病危险的初步探索,如病例对照研究疾病危险的初步探索,如病例对照研究p证实性研究在探索性研究的基础上,初步确定某因素可能证实性研究在探索性研究的基础上,初步确定某因素可能是疾病的影响因素,用于进一步证实。如队列研究是疾病的影响因素,用于进一步证实。如队列研究25医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素探索疾病的危因素探索疾病的危险险因素是因素是l25用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p病例对照研究在医院中应用非常广泛,具有很多优点:病例对照研究在医院中应用非常广泛,具有很多优点:p收集数据快,符合医院特点,可以利用病史快速收集到病收集数据快,符合医院特点,可以利用病史快速收集到病例及对照的数据例及对照的数据p研究时间短,可以很快发现一些疾病的危险因素研究时间短,可以很快发现一些疾病的危险因素p病例对照研究是回顾性的,很大的一个问题是调查对象的病例对照研究是回顾性的,很大的一个问题是调查对象的回忆是否准确。如果这一点能避免,其效率还是很高的回忆是否准确。如果这一点能避免,其效率还是很高的26医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素病例因素病例对对照研究在医院中照研究在医院中应应26用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p病例对照研究最关键的就是选择病例和对照,然后收集他病例对照研究最关键的就是选择病例和对照,然后收集他们的相关数据们的相关数据p选择病例:最好的是从自然人群中选择病例,但实施困难。选择病例:最好的是从自然人群中选择病例,但实施困难。在医院中选择病例非常方便,但有时容易出现选择性偏倚,在医院中选择病例非常方便,但有时容易出现选择性偏倚,如果可能,最好从多家医院选择如果可能,最好从多家医院选择p选择对照:从医院中选择对照,可以是未患有研究疾病的选择对照:从医院中选择对照,可以是未患有研究疾病的其他患者。但需要注意,不能患有与病例具有相同病因的其他患者。但需要注意,不能患有与病例具有相同病因的疾病。疾病。27医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素病例因素病例对对照研究最关照研究最关键键的就的就27用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p例例3:某妇幼保健院采用病例对照研究,欲分析巨:某妇幼保健院采用病例对照研究,欲分析巨大儿的危险因素。该研究设计如下:大儿的危险因素。该研究设计如下:p1、选择某年在该院确诊的巨大儿,作为病例、选择某年在该院确诊的巨大儿,作为病例p2、选择同期正常儿、选择同期正常儿200名,作为对照名,作为对照p3、病例和对照均采用同样的问卷,由医务人员询问调查、病例和对照均采用同样的问卷,由医务人员询问调查相关的危险因素,如孕次、产次、出产年龄等相关的危险因素,如孕次、产次、出产年龄等p4、收集资料,录入数据,统计分析、收集资料,录入数据,统计分析28医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素例因素例3:某:某妇妇幼保健院采用幼保健院采用28用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p数据(部分)数据(部分)编号编号孕次孕次产次产次孕周孕周体重体重(kg)巨大儿巨大儿111384202113848031138490421383905113941061139450711394708113950029医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素数据(部分)因素数据(部分)编编号孕次号孕次产产29用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p变量赋值情况变量赋值情况变量变量变量命名变量命名赋值赋值巨大儿巨大儿y1=是,是,0=否否孕次孕次yc1=1次,次,2=2次,次,3=3次次产次产次chc1=1次,次,2=2次次孕周孕周yzh1=38-39周,周,2=40周,周,3=41周周孕前体重孕前体重wt1=50,2=51-60,3=6030医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素因素变变量量赋值赋值情况情况变变量量变变量命量命30用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p第第1步:探索各自变量与因变量的关系步:探索各自变量与因变量的关系pproclogisticdescplots(only)=(effect(linkjoin=yes);pclassyc;pmodely=yc;prun;pproclogisticdescplots(only)=(effect(linkjoin=yes);pclassyzh;pmodely=yzh;prun;pproclogisticdescplots(only)=(effect(linkjoin=yes);pclasswt;pmodely=wt;prun;31医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素第因素第1步:探索各自步:探索各自变变量与量与31用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p孕次、孕周、孕前体重与孕次、孕周、孕前体重与logit(p)的关系图的关系图32医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素因素32医学研究中的医学研究中的log32用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p孕次孕次2次与次与3次的次的logit(p)值非常接近,可以考虑将值非常接近,可以考虑将2次和次和3次合并为一类。次合并为一类。p体重的体重的logit(p)值基本呈一直线趋势,可考虑直接值基本呈一直线趋势,可考虑直接将其纳入模型。将其纳入模型。p孕周孕周38周与周与39周的周的logit(p)值也非常接近,可以考值也非常接近,可以考虑将这两类合并,将孕周简化为三分类变量,采虑将这两类合并,将孕周简化为三分类变量,采用虚拟变量的形式纳入模型。用虚拟变量的形式纳入模型。33医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素孕次因素孕次2次与次与3次的次的log33用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p第第2步:单因素分析步:单因素分析pproclogisticdesc;pmodely=yc;pproclogisticdesc;pmodely=chc;pproclogisticdesc;pclassyzh(param=referenceref=first);p/*class语句表明将语句表明将yzh作为虚拟变量,以第一类为参照组作为虚拟变量,以第一类为参照组*/pmodely=yzh;pproclogisticdesc;pmodely=wt;prun;34医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素第因素第2步:步:单单因素分析因素分析3434用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p单因素分析结果(经整理后):单因素分析结果(经整理后):35医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素因素单单因素分析因素分析结结果(果(经经整理整理35用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p将产次与是否巨大儿列成四格表,可以发现,其将产次与是否巨大儿列成四格表,可以发现,其中一个格子为空单元(中一个格子为空单元(zerocellcount),产次),产次2次次的人群均发生巨大儿。的人群均发生巨大儿。36医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素将因素将产产次与是否巨大儿列成次与是否巨大儿列成36用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p出现空单元时,导致估计无效,此时可考虑确切出现空单元时,导致估计无效,此时可考虑确切logistic回归(回归(exactlogistic)pproclogisticdesc;pmodely=chc;pexactchc/estimate=both;p/*estimate=both选项表明同时给出参数估计和选项表明同时给出参数估计和OR值结果值结果*/prun;37医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素出因素出现现空空单单元元时时,导导致估致估计计37用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p确切确切logistic回归估计结果回归估计结果38医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素确切因素确切logistic回回38用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p第第3步:多因素分析步:多因素分析pproclogisticdesc;pclassyzh(param=referenceref=first);p/*class语句表明将语句表明将yzh作为虚拟变量,以第一类为参照组作为虚拟变量,以第一类为参照组*/pmodely=ycchcyzhwt;pexactchc/estimate=both;p/*estimate=both选项表明同时给出参数估计和选项表明同时给出参数估计和OR值结果,值结果,注意精确检验的变量必须在注意精确检验的变量必须在model语句中出现语句中出现*/prun;39医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素第因素第3步:多因素分析步:多因素分析3939用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p多因素分析结果:多因素分析结果:40医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素多因素分析因素多因素分析结结果:果:40医医40用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p多因素分析结果(针对多因素分析结果(针对chc的确切的确切logistic):):41医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素多因素分析因素多因素分析结结果(果(针对针对c41用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p为什么孕次(为什么孕次(yc)变得无统计学意义了?)变得无统计学意义了?p可能的假设:可能的假设:p孕次和产次的关系是很密切的,孕次决定产次,孕次和产次的关系是很密切的,孕次决定产次,如果孕次对巨大儿发生有影响的话,那产次只是如果孕次对巨大儿发生有影响的话,那产次只是孕次与巨大儿发生中的一个环节,最终的决定因孕次与巨大儿发生中的一个环节,最终的决定因素是孕次。素是孕次。42医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素因素为为什么孕次(什么孕次(yc)变变得得42用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p删除产次后的多因素分析:删除产次后的多因素分析:pproclogisticdesc;pclassyzh(param=referenceref=first);pmodely=ycyzhwt;prun;43医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素因素删删除除产产次后的多因素分析次后的多因素分析43用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p删除产次后的多因素分析结果:删除产次后的多因素分析结果:44医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素因素删删除除产产次后的多因素分析次后的多因素分析44用用logistic回归探索疾病危险因素回归探索疾病危险因素p孕周(孕周(yzh)的标准误相对较大,考虑将孕周)的标准误相对较大,考虑将孕周40与与41合并合并45医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归归探索疾病危探索疾病危险险因素孕周(因素孕周(yzh)的)的标标准准误误45用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p诊断试验是评价一种诊断方法真实性与可靠性的诊断试验是评价一种诊断方法真实性与可靠性的研究,在临床应用中十分广泛。研究,在临床应用中十分广泛。p一种新的、简便易行或价格便宜的诊断方法,能一种新的、简便易行或价格便宜的诊断方法,能否代替原有的操作繁琐或价格昂贵的方法?否代替原有的操作繁琐或价格昂贵的方法?p新的诊断方法的诊断价值如何?新的诊断方法的诊断价值如何?p真实性、可靠性有多高?真实性、可靠性有多高?46医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验诊试验诊断断试验试验是是评评价一种价一种诊诊断方法断方法46用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p诊断试验的诊断试验的设计过程主要包括以下几点:设计过程主要包括以下几点:p1.明确研究目的明确研究目的p研究者要评价什么?是否有临床价值?研究者要评价什么?是否有临床价值?p2.选择金标准选择金标准p金标准一定是临床公认的诊断所研究疾病的最可靠的金标准一定是临床公认的诊断所研究疾病的最可靠的方法,能够正确地区分有病和无病。方法,能够正确地区分有病和无病。p常用的金标准有组织病理学检查、手术发现、影像诊常用的金标准有组织病理学检查、手术发现、影像诊断、病原体的分离培养以及长期随访结果等。断、病原体的分离培养以及长期随访结果等。47医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验诊试验诊断断试验试验的的设计过设计过程主要包括程主要包括47用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p3.选择研究对象选择研究对象p研究对象的分组以金标准的诊断结果为依据,金标准确诊研究对象的分组以金标准的诊断结果为依据,金标准确诊为为“患病患病”的为病例组,金标准证实为的为病例组,金标准证实为“无病无病”的为对照组。的为对照组。p病例组的病例要具备代表性,即要包括各临床型(如轻、病例组的病例要具备代表性,即要包括各临床型(如轻、中、重型,有或无并发症、早、中、晚期等)病例。病例中、重型,有或无并发症、早、中、晚期等)病例。病例的代表性愈好,新的诊断试验的实用价值愈大。的代表性愈好,新的诊断试验的实用价值愈大。p对照组的人群不等于健康人群,对照组的人群不等于健康人群,而而是被金标准诊断为不患是被金标准诊断为不患有研究疾病但又容易与所研究疾病混淆的人群。有研究疾病但又容易与所研究疾病混淆的人群。48医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验3.选择选择研究研究对对象象48医学医学48用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p4.盲法盲法p诊断试验必须采用盲法评价,诊断试验结果的评判者诊断试验必须采用盲法评价,诊断试验结果的评判者(reader)一定不能预先知道金标准划分的结果,否)一定不能预先知道金标准划分的结果,否则多数评判者会倾向于对金标准判断为则多数评判者会倾向于对金标准判断为“有病有病”的标本的标本给出阳性结果,以致夸大诊断方法的价值。给出阳性结果,以致夸大诊断方法的价值。p5.诊断试验的评价诊断试验的评价p灵敏度、特异度、灵敏度、特异度、ROC曲线曲线等等49医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验4.盲法盲法49医学研究中的医学研究中的49用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p诊断结果诊断结果真实结果真实结果合计合计有疾病有疾病无疾病无疾病阳性阳性a真阳性真阳性b假阳性假阳性n1阴性阴性c假阴性假阴性d真阴性真阴性n0合计合计m1m0N50医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验诊诊断断结结果真果真实结实结果合果合计计有疾有疾50用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验pROC曲线曲线:pROC曲线是以灵敏度为曲线是以灵敏度为y轴、以轴、以1-特异度特异度为为x轴,由不同界值产生不同的点,由线轴,由不同界值产生不同的点,由线段将这些点连接起来形成段将这些点连接起来形成ROC曲线曲线。p纵贯左下角与右上角的直线称为机会线,纵贯左下角与右上角的直线称为机会线,这是划分诊断方法有无价值的一条线。这是划分诊断方法有无价值的一条线。只有曲线高于机会线,也就是曲线下面只有曲线高于机会线,也就是曲线下面积(积(AreaUndertheCurve,AUC)大)大于于0.5才有诊断价值。曲线下面积越大,才有诊断价值。曲线下面积越大,表示诊断价值越高,反之诊断价值越低。表示诊断价值越高,反之诊断价值越低。有学者认为,有学者认为,AUC大于大于0.9表明诊断价值表明诊断价值很高,大于很高,大于0.7表示诊断价值中等。表示诊断价值中等。51医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验ROC曲曲线线:51医学研究中医学研究中51用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p例例4:某研究者欲观察某生化指标:某研究者欲观察某生化指标K和和P对胃癌的对胃癌的诊断价值,以病理检查为金标准划分胃癌和非胃诊断价值,以病理检查为金标准划分胃癌和非胃癌,然后测定两组人群的癌,然后测定两组人群的K和和P指标的值。指标的值。p分析:分析:p这两个指标对胃癌是否有诊断价值?这两个指标对胃癌是否有诊断价值?p两个指标联合是否比单个指标诊断价值更高?两个指标联合是否比单个指标诊断价值更高?p如何找出指标的如何找出指标的cut-off值?值?52医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验例例4:某研究者欲:某研究者欲观观察某生化察某生化52用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p部分数据:部分数据:idKP胃癌胃癌10.01248.01否否20.04262.94否否30.02450.45否否40.07283.18否否50.05291.52否否60.066841.66否否70.101357.4否否80.02458.23否否90.07479.8否否100.108343.36否否110.296403.68否否120.012775.77否否130.048345.68否否53医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验部分数据:部分数据:idKP胃癌胃癌1053用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p指标指标K的诊断价值的诊断价值54医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验指指标标K的的诊诊断价断价值值54医学研医学研54医学研究中的医学研究中的logistic模型精模型精讲讲培培训训ppt课课件件55用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p指标指标K的的cut-off值值56医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验指指标标K的的cut-off值值556用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p指标指标P的诊断价值的诊断价值57医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验指指标标P的的诊诊断价断价值值57医学研医学研57用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p指标指标P的的cut-off值值58医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验指指标标P的的cut-off值值558用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p指标指标P的的cut-off值值59医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验指指标标P的的cut-off值值559用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p两个指标的联合诊断价值两个指标的联合诊断价值60医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验两个指两个指标标的的联联合合诊诊断价断价值值6060用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p两个指标联合诊断的两个指标联合诊断的cut-off值值61医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验两个指两个指标联标联合合诊诊断的断的cut-61用用logistic回归评价诊断试验回归评价诊断试验p两个指标联合诊断的两个指标联合诊断的cut-off值值62医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归评归评价价诊诊断断试验试验两个指两个指标联标联合合诊诊断的断的cut-62用用logistic回归进行分类预测回归进行分类预测p预先已知一群人的患病和不患病状态,根据与疾预先已知一群人的患病和不患病状态,根据与疾病有关的一个或多个指标建立模型病有关的一个或多个指标建立模型p根据建立的模型,当已知某人的指标值时,判断根据建立的模型,当已知某人的指标值时,判断其患病概率,将其归类为患病或不患病其患病概率,将其归类为患病或不患病63医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归进归进行分行分类预测预类预测预先已知一群人的患病和不患先已知一群人的患病和不患63用用logistic回归进行分类预测回归进行分类预测p例例5:某妇幼保健院欲分析乳腺增生的危险因素,经:某妇幼保健院欲分析乳腺增生的危险因素,经logistic回归分析,找出了回归分析,找出了3个影响因素,分别为:个影响因素,分别为:p初产年龄(初产年龄(=25)p有无流产(有或无)有无流产(有或无)p是否母乳喂养(是或否)是否母乳喂养(是或否)p现在要根据这现在要根据这3个因素,预测乳腺增生发生的概率个因素,预测乳腺增生发生的概率64医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归进归进行分行分类预测类预测例例5:某:某妇妇幼保健院欲分析乳幼保健院欲分析乳64用用logistic回归进行分类预测回归进行分类预测p模型预测模型预测65医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归进归进行分行分类预测类预测模型模型预测预测65医学研究中的医学研究中的l65用用logistic回归进行分类预测回归进行分类预测p模型预测结果模型预测结果66医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归进归进行分行分类预测类预测模型模型预测结预测结果果66医学研究中医学研究中66用用logistic回归进行分类预测回归进行分类预测p分类树分类树67医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归进归进行分行分类预测类预测分分类树类树67医学研究中的医学研究中的lo67用用logistic回归进行分类预测回归进行分类预测p叶报表与份额图叶报表与份额图68医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲用用logistic回回归进归进行分行分类预测类预测叶叶报报表与份表与份额图额图68医学研究医学研究68谢谢谢谢69医学研究中的医学研究中的logistic模型模型精讲精讲谢谢谢谢69医学研究中的医学研究中的logistic模型精模型精讲讲69
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