布鲁克核磁培训电子版文档

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资源描述
核磁应用培训笔记一、一维H谱实验操作流程1、新建一个实验,可以直接输入New命令,name :样品名称;PROCNO:处 理号;Solvent :不代表锁场的溶剂,只影响最后打印谱图参数中溶剂项的显 示;Expenriment Dirs :标准实验,不代表脉冲系列;User下,可以建立自己的标准实验;H谱的标准实验名称是:proton2、getprosol :把相关的脉冲参数保存在Acqupars表中:AcquparsPL13、锁场,可以直接点击Lock图表选择溶剂后锁场,或者输入命令LOCK空格 溶剂名称直接锁场;锁场的目的4、atma : topshim5、NS输入数值6、rga7、za即zero go的简写Notice :(1) 调谐:做同一样品的不同谱图时需要重新做一次调谐。(2 )当第一次匀场不好的时候,可以输入命令topshim+空格+tunea进行二 次匀场,若多次匀场后仍然不能达到好的状态则需要做三维匀场。(3) 同一溶剂的样品,建议在同一时段做谱,有利于匀场。(4) 匀场不好的原因有以下几个方面:样品中含有顺磁性金属离子高粘度 样品溶液高度太低。8、部分参数的设置(1) eda采样参数设置:可以输入命令ased进入参数设置界面; PULPROG :脉冲系列名称,zg30:30度角激发,zg:90度角激发; AQ-mod :采样模式 TD:采样点数 NS:采样次数 DS:空扫:真正开始采样前先采集的次数,做一维谱时可设为0,二维谱空扫的次数设置非常重要。 TD0,真正采样次数,NS*TD0,如TD0设为10,NS为1024,则总采样次数为 1024*10 SW谱宽,用默认的谱宽即可,其中SW与AQ成反比 O1P,O1,中心频率,其中前者是以ppm为单位,后者是以HZ为单位。最右边:谱宽/2+O1P(2)和脉冲系列有关的参数 DE值,采样结束后等待衰减的时间。做杂核时需要更改。 D1 :弛豫延迟,做定量H谱时需要更改 P1激发脉宽;PL1(dB):激发功率;9、谱图处理(1)Procpars :窗口函数 efp :指数函数,em、ft、pk三个命令的组合 gfp :高窗函数:gm、ft、pk三个命令的组合 apk :根据当前的样品来调PHC,PHC1,当谱峰有很多鼓包时使用效果不好。Notice : LB值越大信噪比越好,分辨率越差,LB值越小,分辨率越好。LB0是相对于efp函数而言的,当调节LB值为负,信噪比仍然不好时,可用gfp 函数,先更改GB值,再输入GFP命令冲零也可以提高分辨率。(2)定标(3)直接输入plot命令,进入打印界面。(4)如何创建模板C:BrukerTopspinPlotLayouts,先另取名字创建模板,再将模板文件夹下的 默认模板删除,如H谱的默认模板是:1D-Hxwp,先删除该模板,再将 自己创建的模板改为默认模板的名字。二、如何做H谱的定量与标准一维氢谱相比,需要做一下变换1、将脉冲系列zg30改为zg,2、找内标,两个峰挨的很近且基线分离,一般很难找到合适的内标物。3、调整O1R使得O1P在两个峰之间4、NS要足够大,为了保证较好的信噪比,定量最起码要做半个小时以上。5、D15T1,D1要大于5倍的T1,首先要找最大的T1,D1的时间要足够长。三、碳谱:碳谱的标准实验为C13CPD1、getprosol2、atma3、采样参数的设置:谱宽sw 一般设置为250Q1P,NS,TD0,4、rga5、zg6、tr命令:保存数据,继续采样;如tr4,保存最近4次的2倍。7、efp : apk8、ppf :对碳谱的全谱进行标峰。9、Mi+数字+PPF :表示强度低于该数值的不标峰。10、go命令,样品浓度太低的情况下,过夜采集仍然不能得到理想的谱图,第 二天白天需做其他谱图,可在第二天晚上将前一天晚上采集的谱图拖动到当前窗 口,重新放入样品锁场调节后可以输入GO命令进行累加采集。11、和脉冲相关的参数CPDPRG2,通常情况下用Waltz16,做氢谱、碳谱的90度脉冲没有问题, 做杂核时需要更改。Notice :看到碳谱有裂分,首先要考虑是否有同分异构体,再考虑更改 CPDPRG2,选择带bi的参数。四、碳谱定量实验(实验时间相对很长,需要加弛豫试剂以减短实验时间。)1、标准实验选择CBIG , new-ok2、将 zgig30 改为 zgig3、DS:0加弛豫试剂后会影响锁场和匀场。五、DEPT 实验(45、90、135)1、New-C13DEPT90-OK2、getprosol3、修改参数:(1) 改动参数NS,采样次数是普通碳谱采样次数的1/4.(2) Pulseprog查看与脉冲相关的参数,其中NS是4的倍数。DS=8 , NS=4 , SW:谱宽,O1P.4、rga : zgNotice :(1) DEPT45,只出现季碳;DEPT135 :只出现CH(2 ) HALT空格数字(3) SR值,从校正后的普通碳谱的处理参数中copy SR值,复制到DEPT谱 图中,可将DEPT谱图中的化学位移与普通C谱的化学位移对齐。六、如何将多种谱图打印在同一张图上方法一:1、先将全谱图调出并标好化学位移。2、选择1D+1D+1Dxwp打印模板3、在data中,点击ADD,选择实验数据现在的位置,将需要的数据拖入,点 击Apply,确定。此方法的优点是可以对每一张谱图进行修改。、方法二:1、随意拖入一张谱图,输入plot2、全选中,并删除原有谱图3、在DATA里面选谱图,APPLYOK;4、在右侧选择多个谱图叠加的图标,三条重叠的折线;5、在空白处拖动鼠标,出现第一张谱图6、右击选择Edit,选择steaked,输入谱图张数。Spectra : 0*5,0表示左右偏移量,5表示上下偏移量。此方法的缺点是不能单独修改每一张谱图。七、一些补充注意事项1、BBf,探头。2、新安装仪器可以做的核有H、C、P、F、N,可以直接选择标准实验,直接调 用标准模板。P31CPD,全去偶,zgpg30 ; P31 : zg。LOCK之后可以直接输入一系列命令,点击ENTER直接完成。3、做杂核前要先确认两件事情:(1)有无脉宽和功率(2 )有无标准实验;4、P的化学位移的标定:外标法。把标准品(查找网上文献)放到P样品中测定核磁,将标准品的化学位移定 位为0后看SR值,再将SR值复制粘贴到后续做的P谱图上,再标定化学位移。标准品:85%磷酸溶液。不锁场、不匀场,直接调谐、prosol。不锁场实验:(1)打开BSMS键盘,将lock变成灰色。(2 ) sweep要变成 灰色(即将(1)(2 )的0N-OFF都OFF掉)(3)atma ; rga ; zg ;八、对于没有标准实验、没有脉宽和功率的杂核如何入手做以B11为例。1、首先查询该杂核的旋磁比、天然丰度,对于天然丰度太低的要求浓度高些, 或者很难做出来。Help NMR GuideNMR Encyclopedia NMR Application NMR penddic Table-点击要做的元素查看旋磁比和天然丰度。2、先借用C谱的标准实验,新建一个实验,当旋磁比为正时标准实验选择 C13CPD,当旋磁比为负时标准实验选择C13IG。点ok。3、更改参数查看Acqpar参数(都是C13的参数)-getprosol (读取C的脉宽和功率) 输入edsp命令-把F1维中的C13改为B11,F2维不变-Default-Save-再 次回到Acqupars参数中-NS (扫描次数X SW(谱宽,尽量设宽些400) ,O1P (先赋予0 ) +-200位置找峰,D1(经验值)2S,对0也适合,(事先查D1值, 太大可加弛豫试剂)-lock , topshim-输入atmm (不能用atma,手动调谐, 第一次做核时必须用手动调谐。)-出现Tuning对话框,若点找不到会动的 倒峰,则点击图标,放大范围,都调好后点FileSave positionExit-输 入atma ; rga ; zg,弹出rga对话框,点01256)SW,O1P;D9 :自旋锁定 时间,默认值为,即混合时间(设短的话可能会无法调整相位)2、lock3、atma ; topshim ; getprosol ;4、谱图处理(1)输入命令xfb变换谱图(2)调等高线(3)调相位,先调0级相位,再调1级相位。(4)校准(三)实验三1、New-NOESYPHSW-适用于大分子2、NS : 8*N; DS:16*N;D8混合时间,空间v 5a,峰的强度与距离的六次 方成正比。对于大分子,D8= ;对于小分子:D8=。Notice :分子量越大,弛豫时间越短,分子量越小,弛豫时间越长,温度越高 弛豫时间越短。3、lock4、getprosol5、atma ; topshim ; rga ; zg(四)实验四1、new,标准实验选择ROESYPHSW,PH :通过相位循环可以减掉一些峰。2、具体实验步骤与前面的实验步骤大致相同,通过查看与脉冲系列相关的参数 对参数进行设置。接着 LOCK,getprosol ; atma ; topshim ; rga ; zg3、Notice :输入 Set 命令,选中 Enable automatic command spooling 方 框内打钩。可以针对一个样品的自动排列做多个实验。(五)实验五:J-Resolved同核实验。1、newcosy45sw (先借用)2、Pulprog : jresqf(消除化学位移,保留耦合常数)3、NS:4*N ;DS:16;4、F2维(化学位移);F1维(耦合常数)SW=20,SWH = 50HZ,O1P只针对F2设定值,F1不用设。5、getprosol6、lock7、atma ; topshim ; rga ; zg ;(六)实验六H-C相关的二维谱1、New,选择标准实验:HSQCETGPSISFJET表示采样模式为回波反回波采样; GP梯度;SI灵敏度增强;SP形状脉冲,让激发更均匀。2、输入命令eda,进行采样参数设置:NS=1*N,DS216,TD,SW谱宽(F2为H 谱谱宽,F1为C谱谱宽);输入命令ased可进行与脉冲系列有关的参数设置,CNST2 :单位为H乙C 和H直接耦合常数的平均值。GPZ2 , C:% ,N15,%,若有些杂核没有显 示,则改核后可以输入命令gradratio查看3、lock4、getprosol;atma;topshim5、rga;zg(七)实验七1、New-HMBCGPND, ND表示在采样时间内不进行去耦。2、(1)采样参数设置 NS=2 , DS=16,O1P=,SW=(2 )与脉冲系列相关的参数设置,CNST13,远程耦合常数,系统默认一般 为8H乙可以适当地减小,当看不到交叉峰时,可能该值设大了,也可能是因 为二面角的原因。,通过耦合常数可以计算二面角的大小。3、lock4、atma;topshim;rga;zgNotice : HMBC谱图中可能存在HSQC的残余峰。(八)实验八,在HMBC二维谱中去除HSQC的残余峰。1、newHMBCGPND,Ttitle : J-Filter HMBC2、更改脉冲系列及参数将 PulprogHMBCGPL2ndqf(1 )输入命令 eda,更改采样参数,NS=2*N,DS=16 , QF , TD(分 F1, F2), O1P(2 )输入命令ased ,更改与脉冲系列相关的参数, CNST6:120HZ;CNST7180H乙在该区间内HSQC残余峰去除。CNST13,百 分比根据右侧提示填写。3、getprosol4、lock5、atma ; topshim ; rga ; zg十、完整的二维谱图处理过程1、输入xfb,谱图变换;2、调入一维谱,选择F1+F2 ,-ok3、clev32,修改等高线。4、校正相位(NOESY、ROESY、TOCSY、HSQC需要校正相位,其他的不需 要)点相位校正图标,选几个点,ADD,先校正红线所在的位置。5、定标:先定好一维谱,读出化学位移,再点击定标图标,找出中心位置进行 定标。6、去除噪音,(T1噪音的去处),左边没有信号的投影。Projeditupdateok第一个正峰第二个负峰,输入sub2。7、可以通过选择性预测提高F1的分辨率,edpprocparsfounerME_mod选择LPfr( LP表示线性预测,fr表示向前的)NCOEF( HH相关选100 , HC相关选32 )。此处理的缺点是可能产生鬼峰。十一、核磁的维护(一)硬件维护1、机柜里面的滤网一般一年清洗一次2、建议每周重启电脑一次3、打开机柜需要带放静电手环4、每次严格开关机,关机开机后要做一次CF。5、90度脉冲校准正常情况下半年做一次,对新仪器可能需要三个月做一次。6、field的校准,正常情况下半年一次,对于新仪器三个月做一次。(二)磁体及软件维护1、1H 90度脉冲的校准,标样:%EB in CDCL3J(1) new,建立实验,选择PROTON标准实验,title : 1H90cal(2 ) lock(3 ) getprosol ; atma ; topshim(4) 更改参数 输入命令eda更改采样参数,将zg30-zg ;NS=1, DS=0;O1P=(即设定在乙基的四重峰中央)。 输入命令ased更改与脉冲系列相关的参数,D1=20S,RG=16; P1=记录下来(脉冲作用时间)改为2;PLW1机PL1保持不变。Notice :先把原来的P1值,再将P1赋予一个比较小的时间,eg , 1us先试做 谱看看。(5) rga;zg(6) efp; apk,处理谱图,并找到四重峰,使当前窗口只出现四重峰。(7 )输入命令dpl ,定义打印区间。(8 )回到处理参数procpars,将PH_mod中的模式改为PK(9 )输入命令POPT,脉冲的功率为脉宽的优化模式。勾选第三个选项即perform automatic baseline(PARAMETER写上 P1QPTMUM 中选zero , STARTVAL开始值:比原有值的三倍大一些即大于3*; ENDVAL结束值:比 原来的四倍大一些,即大于4*+4; INC步长一般定为2,36、38等等),填 好以上各参数后,点击StaroptimlzeiSaveTokT开始做实验若出现负 值的峰,说明已经越过180度得电,点击skip current optim_停止实验。结果存在TITLE里面,不用记录。在Acquars中的Pl(us)得到值/4, 得到的值其实是零点的值,即360度得值,除4即可得到90度的值。(10 )更改prosol表,输入命令edprosol,将左右通道的pulse值改过来 Saveselect all relevant ok输入密码okyesokyesok,关闭窗 口。2、C13的90度脉冲,标样:ASTM。(参考讲义P48 )(1) newPROCNO(处理号一定为1)C13CPD(标准实验名称)(2 ) getprosollock 溶剂名称atma ; topshim(3 )修改参数,输入命令eda修改采样参数:将zgpg30改为zgpg ;NS=1;DS=0 ,O1P=67 ,O2P=输入命令ased修改与脉冲系列相关的参 数:RG = 32 或 64;D1(S)=20; P1先记录下原始数值如,先赋予小点的值如2us(4 )输入zg命令直接采样(5) efp; apk让窗口只出C的信号,输入dpl ,以下步骤与H的90度脉冲一 致,可参考H的90度脉冲。Notice :测完后要到prosol表中进行更新。3、如何计算当前样品的90度脉冲值(1) new设定好参数之后做pulsecal(2 )输入命令pulsecal , enter后可以计算当前样品的90度脉宽,测完后点 击close。第一次做pulsecal命令时会弹出对话框该命令正在编译直 接close掉就可以了。4、3D匀场,标样:90%水+10%重水。(2 ) lock H20+D2O(3 ) atma ; topshim gui (可以去除Y方向的匀场梯度)(4) 选 3D-After : ZX-Y-XZ-YZ-Z (不做 Before )Star结束后点 close。(5) 选一 常做的样品,做一个维 H 谱,lockgetprosol ;atma ;topshim(6 )输入wshi在filename中输入文件夹名称writecloseNotice :怎样判断匀场好不好看DMSO、甲醇、丙酮的多重峰看TMS的 卫星峰看溶剂本身的峰信号,越窄越好。5、lock field 的校准方法一:锁场锁氘信号,标样用10%的EB in CDCl3(1) 进样(2 ) lock CDCl3(3) 进入BSMS键盘Tocklevelfieldi读取field值并记录下来()点 ON-OFF脱锁输入命令lopo , enter进行锁场参数的优化选溶剂,点ok 输入(锁场后的值)。Notice :红线和绿线的交叉点在锁场的最中间,蝴蝶线完全对称,通过更改 phase值可以使其变得对称,从交叉点出来的第一个峰都是向上的。(4 )点击stanby,命令行中输入edlock,点折线图标进行保存。方法二:什么溶剂都锁不上的情况下使用该方法(1) 放H20+D2O的标样进去(2) 将 sweep 的 ON-OFF 关掉(3) 修改采样参数,建立一个H 谱 zg30 , NS=1, DS=0 ,O1P=, SW=30 40ppm(4) atma ; rga ; zg ;(5 ) efp ; apk(6 )找到水峰,看水峰与偏离了多少HZ,在procpars中将PH_mod改为pk ;(7 )输入命令gs,点实时变化谱图,打开BSMS键盘,进入locklevel里面, 调节filed值,使水峰到达的位置,到达后点Standby,输入命令edlock , 点折线图标,保存。(8) 将6,界面stop掉(9) 用CDCl3样品做校准。十二、一维选择性激发实验1、实验一:针对分的比较开的峰(1) 新建一个实验,做一个一维谱。(2) 点击积分符号,在自己想要的信号上,对其进行积分。(3) “Save as veg”右击保存图标,保存。(4) 输入 buttonnmr,选择 select.(5) 点击set Gr ROESY-OK-输入实验名称后点OK-OK:不能再更改参 数,直接采样;cancel只是建立实验还可以修改参数。本例中选cancel。(6) 修改 NS=8%N , DS=4*N(7) rga;zg(8 ) ef-相位校正,一般会出现三种信号:相关信号、吸收型信号、色散信号。2、实验二:针对重叠比较严重的多重峰。CSSF:chemical shift 化学位移,selective filter。(1) 进样,采集一个一维谱(2) 找到重叠峰,拷贝其中的一个化学位移:所关心的峰的中间位置。(3) 新建一个实验,修改O1P为前一步骤的化学位移值。(4 )更改脉冲系列(pulprog ),选择sel -ok(5) 查看参数,修改NS=2*N,DS=16 , TD0=816,部分参数根据右侧提示 修改。CNST2=4(此值取决于峰的重叠程度)(6) rga;zg3、实验三(1) 在实验二的基础上,输入命令i,I命令表示做同样的实验。(2) 更改脉冲系列,将-(2表示第二个版本,为了选择峰;带zs表示能量子 激发;di自旋锁定,cosy峰为了找相关谱)(3) 更改参数D9 (混合时间X NS、DS、TD0等参数。(4) rga;zgNotice : cosys tocsy、noesy、roesy 对角峰、交叉峰都有;hsqc、hmbc 没 有对角峰,只有交叉峰。十三、溶剂峰的压制1、只压制一个峰(1)做一个一维谱,找到要压制的峰,复制化学位移。(2 ) new-标准实验名称为:WATERSUP对应的脉冲系列为NOESYGPPRId -ok(3) 设置实验参数,D1 :低功率、长时间的功率,关键设置参数D1和PL9。 对于NS、DS无严格要求;PL9=60dB (该值越大,实际功率越大); D1=2s(时间越长,频率覆盖范围越窄);O1P的值直接粘贴步骤一复制的 化学位移值,谱宽要足够大。(4 ) getprosol ;2、压制两个峰(1) edc-标准实验名称:LC1D12-OK(2 ) O1P:压制峰1的中间位置的化学位移值(谱图的中间)O2P :压制峰2的中间位置的化学位移值。(3 ) getprosol(4) NS=8*N,DS=4,PL9=60(5) rga;zg3、如何压制多个峰(1) new-LC1DCWPS(标准实验名称)(2) 修改参数NS、DS、SW(3 ) getprosol(4) 输入命令L30(即压制峰的个数,如N)(5) 输入命令xaua (自动采集一个一维谱),压制N个最强的峰4、水峰的压制(与压制一个峰的步骤是一样的)(1) newWATERSUBNOESGPPR1d(2) O1P 的确定,NS、DS、D1、PL9(3) getprosol(4) lock(5 ) atma ; topshim ;(6 ) RGA-RG,记录 RG 值(7) rga; zgfpallapk(8) 更改O1值(9) rga;zg(多次循环,直到水峰的压制达到好的状态)5、实验五(1)edc( new )-NOESYPR1D(标准实验名称)(2 ) D8=;NS、DS(根据提示确定);O1(O1P=、D11=30ms=, D1=2S;PL9=5060Db(不宜给太大的值)(3) getprosol(4) lock(5) atma;topshim;rga;zg拓展实验:输入I命令-NOESYGPPR1d (加梯度场实验),更改梯度参数。Notice :加梯度场对锁场相位要求比较高。十四、Topspin软件介绍1、通过命令re、rep、rel、repl+空格+数字打开文件2、rel:打开最后一个实验名称下的实验号。Repl:实验号下面的某一处理号。3、命令expl :按照或者版本的统一存放数据。4、命令.all5、E命令,选择要看的区域6、批处理:processingisenal processingFind 找到实验名称next;efp ; apk ; ppf (标峰)(输入一系列命令符)iexcuteiclose。Notice : LB增宽因子指数窗函数。7、批处理积分(intser批处理积分命令)(1)先对第一张谱图进行积分并保存(2 )输入命令intser(3)选择第几个实验inext(4 ) options ( calibrate :选定某一个位置;Normalize sum of integrals 归 化法)i第几个峰i定义几个iok,归一化值加和多少,可以自己增。8、增加一个处理号(wrp命令)Corl dram预测化学位移9、去卷积(去卷积的峰保留在999的处理号上面)AnalysisiDeconvolutioniokioption(用什么函数(use lorent zian shape )选择区域(阈值)iok10、进入topspin用户名和密码的设置Set 命令 ioptionsiadmmistrationilock topspin user interface11、电子签名:Electromic signature creation,输入命令 esign12、audit跟踪文档,可以看到所有的操作13、更改layout的三种途径输入命令layoutcontrl + P处理参数中的 Automationilayout14、模板保存的路径,C:Brukerplotlayouts15、stack1d多个谱图叠加16、parplot参数修改17、输入命令almana。打印化学位移18、利用NMR Guide自学:NMR Guide-输入关键词一搜索19、Helpmanuals1D2D step-by-step basic 多利用资源自学。十五、T1、T2的测定1、1H的T1的测定(做二维时也需要控温)(1)做一个一维H谱(目的是看看匀场好不好有没有合适的谱宽和O1P )Newgetprosollockatma ;topshim ;NS=1;DS=0 ;rga ;zg-efp ; apk(2 )输入命令Iexpno :完全拷贝当前实验的所有参数,只是实验号加1,目的 是为了谱宽和O1P都不变。,一一r(3) 进入采样参数栏,将zg30改为t1ir (实际是假二维)一点图标(目的是将其改为二维),弹出对话框,点OK到脉冲参数里面看采样参 数:NS=8*N(此参数设置是实验的关键),DS=4 , FnMODE选undefined TD(f1:变换等待时间,一般给10即可;f265536 ) ,SW(F2:氢谱的谱宽, 不变;F1不用管)一点击左侧LIST,找到VDLIST,自己定义一个VDLIST,edit (填十个点,这是个点必须包含在弛豫时间内,前面的点密集些,后面的点系数 些,如,,,135,10 )其中最大值的确定是关键,要保证做出来的曲线变化要么 是向上的一个平台,要么是向下的一个平台。设置好后保存一回到与脉冲相关的 参数上,D1(S) = 10 , D1值必须要大于或者等于VDLIST中设置的最大值,设置 好 VDLIST 后rga ; zg(4) 数据处理更改处理参数(procpars ) SIF1的一定是偶数,如16,其中SI(F1) TD(F1); SI(F2) TD(F2);输入命令xf2 (表示只对f2做傅里叶变换)一点击 相位调节图标,将十字线放在最下方,点鼠标右键选ADD (只需选一个点) 点R图标:出现氢谱,只需调节好氢谱的相位一保存,退出一返回处理参数 propars中,将F2维中的PH_mod改为PK一点Analysis中的T1/T2”图标, 进入右侧界面一点第一个图标折线FID”,弹出对话框,选spectrum,弹出下 个对话框,slice , number=1, ok点第二个图标peaks ranges :弹出对话 框,选manual integration,弹出另一对话框,点ok,进入积分模式,选择峰 并进行积分一积分后点击带A的保存”图标,选第三个选项Export regions to relaxation module and ret点第三个图标:relaxtion , widowsfiting funtion uxnmrtllistfile name : vdlist点数是前面设置的点数10,检查以 上三项无误后输入ok,点击沥”图标,全部点拟合曲线一查看拟合曲线一输 入plot命令一点击T1/T2,拉动左键。2、1H的T2的测定(自选回波)(1)做一个一维H谱(目的是看看匀场好不好有没有合适的谱宽和O1P )Newgetprosollockatma ;topshim ;NS=1;DS=0 ;rga ;zgefp ; apk(2 )输入命令Iexpno :完全拷贝当前实验的所有参数,只是实验号加1,目的 是为了谱宽和O1P都不变121(3) 修改脉冲程序,改为cpmg,将一维模式改为二维模式。(4) 在与脉冲相关的参数里面查看NS、DS、Fnmode的定义(5) 修改 NS=8*N,DS=16,TD(F2=65536 , F1=10), Fnmode:Nodefined , SW不变。(6 )在LIST中,编辑VIDLIST (表示的是循环次数)表,如: 2,10,20,50,100,200,300,500,750 ,(最后一个值的确定根据 D2O 来计算, 是关键),单个循环时间=2D2O+P180保存。(7 )回到采样参数中,查看和脉冲系列相关的参数,D2O稍微大于50*P2 (注 意单位换算),D1值的设定,表示弛豫的恢复时间,与T1有关,D15T1, 本例中D1=10s ;测T2实验中的关键参数有:D2ONS、DSTDS1 维VVLIST的设定,最后一个循环次数由D2O决定。(8) rga;zg(9 )谱图处理(与T1的处理过程类似,唯一区别是拟合出来的是循环的次数)更改处理参数(procpars ) SIF1的一定是偶数,如16,其中SI(F1) TD(F1); SI(F2) TD(F2);t输入命令xf2 (表示只对f2做傅里叶变换)-点击 相位调节图标,将十字线放在最下方,点鼠标右键选ADD (只需选一个点)- 点堂图标:出现氢谱,只需调节好氢谱的相位-保存,退出-返回处理参数 propars中,将F2维中的PH_mod改为PK-点Analysis中的T1/T2”图标, 进入右侧界面-点第一个图标“折线FID”,弹出对话框,选spectrum,弹出下 一个对话框,slice , number=1, ok-点第二个图标peaks ranges :弹出对话 框,选manual integration,弹出另一对话框,点ok,进入积分模式,选择峰 并进行积分积分后点击带A的保存”图标,选第三个选项Export regions to relaxation module and ret-点第三个图标:relaxtion , widowsfiting funtion uxnmrtllistfile name : vclist点数是前面设置的点数10,检查以 上三项无误后输入ok,点击沥”图标,全部点拟合曲线-查看拟合曲线-输 入plot命令-点击T1/T2,拉动左键。Notice :此时得到的T2不是真正意义上的T2,而是循环次数,因此T2 的实际值计算公式为:如本例中得到的值为,则T2的实际值=* ( 2D2O+P180 ) =* ( 2D2O+P2 ) =* ( 2*+*10-6S ) =151ms,注意单位换算,P180 即为 P2。C的T1的测定:脉冲系列选择tlirpg。十六、如何设置命令的自动排列(1 )输入 set 命令-Adiministration,勾上 Enable automatic command sppoling-ok(2 )set-more preferences -status bar prefrences -change 勾选需要显 示的栏目-Apply-ok-最下方空白处右击并将Acquisition bar on/off 关掉状态栏,关掉后再打开。十七、如何建立宏命令的图标(1 )输入edmac命令,edmc编辑宏命令,edmac+空格+宏命令名称输入 efpapk.AllAbSNppf-点file工具栏保存关闭(2 )在菜单栏(目标栏)点右键,选择Add user defined button 出现对 话框Add/modify a button with text label(文本)Add/modify a button with an anicon (图标)(3) Abs :自动积分;AbSn基线调整。十八、H-P相关谱(1) new Acetone,标准实验名称:hmbcgpnd ( nd表示在采样过程中对 C13不去偶)(2 )更改参数:输入命令 EDSP,将 13C 改为 31PDefaultSaveCloseo(3 ) getprosol(4 )更改采样参数sw (f1) =400 :ns=2*n , DS=16 :NUC1, f1 改为 31P : O1RO2P=-50;更改与脉冲系列相关的参数:CNST13 : (BC,关键参数)凡是带梯度的 实验,异核相关相关要设好核的梯度场,输入gradratio (改核后再修改)单 出对话框,显示三个数值,依次填入梯度场中的参数设置中。(5 ) lock : acetone(6 ) atma ; topshim ; rga ; zg(7)输入乂化处理,dev32(8 )当右侧谱宽出现几万的值的时候,输入sref,回车,close , close。(9) 定标Notice : Nucleus1中的nucl的OFF改为所要做的杂核。十九、变温实验(1) 50C以下,用塑料转子即可,若大于50C时,要用陶瓷转子,做高温变 温实验时,气流量要设置的大一些,并用惰性气体保护线圈。气流量要大陶 瓷转子用惰性气体保护线圈。(若气流量太小,会导致样品管底部温度与上部 温度不一致,导致梯度气流量大,等待时间也短。)放样品先锁场,锁好场后调大气流量,调到气流量脱锁时,再将气流量调 小到能锁场即可。高温实验:温度不能达到或者超过溶剂的沸点,最高温度要低于溶剂沸点的 10 20C,加热功率值建议调到7%左右。(2) 低温实验在将铜管插入低温杜瓦之前,先将铜管连接探头与高纯氦,要 用高纯氦吹十分钟左右,再迅速将铜管插入液氮杜瓦瓶中。夏天的时候需要把气流量开大些。(3) 输入命令edte (温度控制),probuheater加热功率值建议3% 5%。高 温和低温实验都要求气流量大及加热功率要大Gas flow :常温控温,建议400 ; 其他控温,建议500 ;BCU:低温附近;self tune :温度设好加热功率设好。二十、锁场锁不上的原因 选错溶剂 锁线很粗:溶剂高度太低或者正常关机开机一次。 弛豫试剂加多了。下方状态栏,POWCHK:自检功能;spooler :命令的自动排列;BSMST匀场线 圈温度。二十一:如何开关POECHK :(做cf的时候可以打开或者关闭)二十二、cf计算机与机柜之间的通讯是否顺畅(关机后开机需要做一次CF)输入命令Cf输入密码brukereditnext (有异常情况可以拷贝给工程师) next ; security , enable peak power check ( POWCHK )后的方框打钩。 next restore , save , next amplifier 功放,对应三块, X150W,H60W,2H20W检查连线是否正确,savenextexpinstall :安装标 准实验,标准脉冲系列edsolv :编辑溶剂后saveedhead更换探头后要做, 保证连线正常。edprosoledlockedscon不能更改。finish二十三、添加溶剂(1 )输入命令edsolv编辑溶剂信息ok(2 ) edlock,找一个最接近的选中,点击new solven图标,选(1)中所填 的溶剂,ok。(3)添加distance,在其他溶剂中加所要添加的溶剂,读取化学位移,适当地 增大 lock power。二十四、icon的使用1、输入icon命令:routine spectroscopy :可以进行一步一步的操作; Automation :自动进样器;ToolBox生物大分子;configuration设置Configuration : user settings :设定新用户,可进行权限的设置,如可以进行 哪些实验,能改哪些参数。Automation自动进样器相关的。Accounting :统计实验数目及实验时间。(1)建立新用户:在Additional users中建立,建立好后再退出,重新打开后 点save即可激活,将鼠标放在用户上即可对其进行设置。右边列表即可限定用 户可以做哪些实验、修改、删除、更改顺序。N :单一实验;C :组合实验。 Experiment list(组合实验要针对二维实验,若有活泼H尽量避免做组合实验, 适合做单一实验。输入命令wpar可以建立标准实验,存在user的路径下。(2)permissions用户权限设置:将priotity(优先权)打钩即可插队。Archive Data数据备份;Exit( Icon NMR)退出并输入密码;Originator :对 用户进行分类。Manual lock/shim:是否可以手动操作;print spectrum(3)Data set Names,data Directorise(4)othersettings(5)AutomationMaster switches :manunal Inject/Eject,手动自动进样,holder 设为 1 ;Enject last sample in queue :是否弹出最后一个样品。(6)lock/shim options,solvent/probe dependcies:每一次用 ICON之前需要用匀场文件,直接拷贝。(7)在parameters中可以更改所有参数,ICON界面(8)批处理
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