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SigmaPlot 10.0, ImagePro- Plus 6.0,等软件的使用 邓志钦 2020/11/29 1 主要内容 1 运用 SigmaPlot 10.0 做全程图 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 3 运用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲线 4 运用 SigmaPlot 10.0做断点柱状图 5 运用 ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积 6 运用 ImagePro-Plus 6.0截图 7运用 ImagePro-Plus 6.0分析灰度值 8 ImagePro-Plus 6.0定标 2020/11/29 2 1 运用 SigmaPlot 10.0 做全程图 1 运用 SigmaPlot 10.0 做全程图 2020/11/29 3 1 运用 SigmaPlot 10.0 做全程图 1 点击“ File” “ Import” “File”, 找到你 对应的文件,打开格式为“ *.TXT”的文件。 或者 快捷键“ Ctrl + L” 2020/11/29 4 1 运用 SigmaPlot 10.0 做全程图 2 点击 “ Import” 打开格式为“ *.TXT”的文件。 2020/11/29 5 1 运用 SigmaPlot 10.0 做全程图 3 点击 “ Import” 。 2020/11/29 6 事件 时间 (s) 电流( nA) 4 把事件一栏 删除,保留时 间和电流。 2020/11/29 7 1 运用 SigmaPlot 10.0 做全程图 5“时间”栏,从 0开始;点击散点图,开始作图。 2020/11/29 8 1 运用 SigmaPlot 10.0 做全程图 5 选择“ XY pair”, X 轴是时间, Y轴是电流。 2020/11/29 9 1 运用 SigmaPlot 10.0 做全程图 2020/11/29 10 1 运用 SigmaPlot 10.0 做全程图 6 双击,对图形进行编辑。“ Lines Thickness”调整线条厚度, “ Scaling Range”调整坐标刻度范围; “ Ticks Tick intervals Major Tick ”调整坐标刻度间隔。 保存文件,可以作为模板。 坐标轴标题 22 号, Times New Roman, 字符和单位之 间要空一格, 画出横线,说明加药时 间,横线厚度同样 0.5 按需调整坐标 刻度范围,字 体 20号。坐标 轴厚度, 0.5。 2020/11/29 11 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 2020/11/29 12 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 1 以制作加药稳定后的瞬时图为例。 单击,选中加药稳定后一点。 2020/11/29 13 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 2 返回“ data”窗口,图中绿色标记的就是这时间中 0, 40, 80mV所对应电流。以这 5个电流为基础作瞬时图。 3 从图中可以看到,这 5个电流所对应的事件是: 457-461。这时候 打开 2020/11/29 14 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 4双击,打开 signal2文件夹里的“ Cfsview”应用程序。 2020/11/29 15 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 5点击“ FileOpen ” ,选择这个细胞所对应的 “*.DAT”文件。 2020/11/29 16 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 6 直接输出生成瞬时图文件。 点击“ FileExport As” ,更改文件 类型 *.TXT 和文件名,点击保存 。 2020/11/29 17 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 7 点击“ OK” 2020/11/29 18 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 8 更改“ Frames”内容为刚才选中的这一时间段所对应的事件即: “ 457.461” (中间两个点需在英文状态下输入),点击“ Export” 2020/11/29 19 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 9 打开“ SigmaPlot 10.0”,打开刚才用 signal2保存的文件。 2020/11/29 20 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 10 点击线条图 (第一栏第一个 ),选择 “XYpair”, 点击“下一步”, “s”为 X轴, “chan 0”为 Y轴,点击“下一步”。 2020/11/29 21 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 11 双击纵坐标轴,“ Scaling” “ Scale type”,选择 “ Linear” 更改类 型。点击横坐标,同样更改类型。 2020/11/29 22 2 运用 SigmaPlot 10.0和 signal 2 做瞬时图 12 双击,对图形进行编辑。 “ Tick Label Factor out 1e-3”调 整横坐标, 保存文件,可以作为模板。 坐标轴标题 22 号,字符和单 位之间要空一 格 . 说明处理因素 按需调整坐标 刻度范围,字 体 20号。坐标 轴厚度, 0.5。 Tick LabelFactor out 1e -3”调整横 坐标 2020/11/29 23 3 运用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲线 3 运用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲线 2020/11/29 24 1 返回“ data”窗口,图中绿色标记的就是这时间中 0, 40, 80mV所对应 电流。复制电流到 Excel表格中,按顺序或倒序排序,用 电流 /电阻( pA/pF ) 得到这一个细胞的 电流密度 。同理,获得 5个以上 的数据,作为统计,得到 mean std.err。 3 运用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲线 2020/11/29 25 2用 电流 /电阻( pA/pF ) 得到这一个细胞的 电流密度 。同理,获得 5个以上 的 数据,作为统计,得到 mean std.err。 3 运用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲线 2020/11/29 26 3 运用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲线 3 按下列格式排好,制作点线图。 X 轴 Y1轴 Y2 轴 2020/11/29 27 3 运用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲线 4 单击,点“下一步”,“ data format”选择 “ X many Y” 完成。 2020/11/29 28 3 运用 SigmaPlot 10.0做 I-V 曲线 5 按需对图形进行编辑。 2020/11/29 29 4 运用 SigmaPlot 10.0做断点柱状图 2020/11/29 30 4 运用 SigmaPlot 10.0做断点柱状图 1 组间差异很大,需要对柱状图做出调整。 2020/11/29 31 4 运用 SigmaPlot 10.0做断点柱状图 2 双击坐标轴,点击“ Breaks” “ Show breaks” 更改合适的断点位置,点击 “确定”。再对图形做出合适的编辑,如柱子颜色,组间距离,线条粗细,字体字号 等。 2020/11/29 32 4 运用 SigmaPlot 10.0做断点柱状图 Time (s) ctrl 24h 48h 72h C lC -3 m R N A 0 20000 30000 40000 2020/11/29 33 5 运用 ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积 2020/11/29 34 5 运用 ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积 1 打开目标图像。点击“ Edit” “ Show breaks” “Duplicate/Crop to AOI” 2020/11/29 35 5 运用 ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积 2 点中新创建的图像,点击“ Best fit equalization”使图像均衡化。 2020/11/29 36 3 选择菜单栏的“ Measure” “Count / Size”, 打开 “Count / Size”对话框。 5 运用 ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积 2020/11/29 37 5 运用 ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积 4 选择 “Count / Size”对话框中的“ Select Ranges”。打开“ Segmentation”对 话框,拖动对话框中“ histogram Based”框条和时间轴, 保证每个时间点时 红色部分填充满细胞,使细胞与背景尽量分开 。完成后选择“ Apply Mask” “Closd”。 2020/11/29 38 5 运用 ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积 5 完成后点击一次 “Count / Size”对话框中的“ Count”。这时候看到已经有 106个点被标记。 “Count / Size”对话框中的“ Measure” 点击“ Select Measurements”,打开测量选项对话框。 2020/11/29 39 5 运用 ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积 6 选择测量选项对话框中 : “Area”, “ Center-X (mass)” , “ Center-Y (mass)” 和“ Roundness”四个测量选项。分别对它们进行编辑范围。 2020/11/29 40 5 运用 ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积 7 编辑 “Area”, “ Center-X (mass)” , “ Center-Y (mass)”和“ Roundness”四 个测量选项范围,同时观察左边红色部分的变化,使得细胞面积都在这个范 围内。完成后点击“ OK”,第二次 点击 “Count / Size”对话框中的“ Count”, 这时候看到已经只有 27个点被标记。 。 2020/11/29 41 5 运用 ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积 8 第二次 点击 “Count / Size”对话框中的“ Count”,这时候看到已经只有 27 个点被标记 。 2020/11/29 42 5 运用 ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积 9 点击菜单栏“ Measure” “Track Objiets”, 打开对话框,点击对话框 中“ ”图标 ,开始测量。 2020/11/29 43 5 运用 ImagePro-Plus 6.0快速测量细胞面积 10 测量完成后,点击图标“ ”, 对离群值进行剔除 ,然后输出结果到 Excel,就可以算出面积和体积了。 2020/11/29 44 6 运用 ImagePro-Plus 6.0截图 2020/11/29 45 6 运用 ImagePro-Plus 6.0截图 1 点击“ Edit” “AOI” 调出 AOI对话框。点击 AOI对话框中“ Add” , 增加一个区域,命名,保存。 2020/11/29 46 6 运用 ImagePro-Plus 6.0截图 2 打开图像,点击下方按钮,选中需要截图的区域。“ Ctrl + C” 打 开 PowerPoint文档, “ Ctrl + V” 。直接复制粘贴选中的区域。 2020/11/29 47 6 运用 ImagePro-Plus 6.0截图 3 按时间轴,把细胞序列切换到你感兴趣的时间点。双击 AOI对话框中刚 才所命名的文件。 “ Ctrl + C” 打开 PowerPoint文档, “ Ctrl + V” 。 直接复制粘贴选中的区域。 2020/11/29 48 7运用 ImagePro-Plus 6.0分析灰度值 2020/11/29 49 7运用 ImagePro-Plus 6.0分析灰度值 1 打开图像,打开 “Count / Size”对话框。 2020/11/29 50 7运用 ImagePro-Plus 6.0分析灰度值 2 选择 “Count / Size”对话框中的“ Select Ranges”。打开“ Segmentation”对 话框,拖动对话框中“ histogram Based”框条, 保证红色部分填充满你的条 带,使条带与背景尽量分开 。完成后选择“ Apply Mask” “Closd”。 2020/11/29 51 7运用 ImagePro-Plus 6.0分析灰度值 3 完成后点击一次 “Count / Size”对话框中的“ Count”。这时候看到已经有 106个点被标记。 “Count / Size”对话框中的“ Measure” 点击“ Select Measurements”,打开测量选项对话框。选择“ IOD”,点击“ OK”。 2020/11/29 52 7运用 ImagePro-Plus 6.0分析灰度值 4 选择 “Count / Size”对话框中的“ View Data”。打开“ Measurements Data” 对话框。点击“ File”,输出数据到 Excel。 2020/11/29 53 8 ImagePro-Plus 6.0定标 2020/11/29 54 8 ImagePro-Plus 6.0定标 2020/11/29 55 2020/11/29 56 IPP 使用教程网站: 2020/11/29 57
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