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医学文献主题标引 Medical Literature Subject Indexing,李炯 bzmclj,第六章 医学主题词表 Medical Subject Heading (MeSH),第一节 MEDLARS/CBLARS 第二节 医学主题词表 第三节 树状结构表 第四节 在线MeSH表,第一节 MEDLARSCBLARS,一、MEDLARS MEDLARS全称为Medical Literature Analysis and Retrieval System(医学文献分析和检索系统)。 由美国国立医学图书馆(NLM)研制、开发的当今世界上最具权威性的医学文献检索系统。 1971年10月创立MEDLINE数据库。,MEDLINE数据库是MEDLARS中最大的医学数据库,也是世界上最权威的医学数据库。 收录70余个国家5000多种生物医学期刊的题录与文摘. 现有1950年以来的1650多万篇文献的记录。 目前每年增加60余万条文献记录 在全部记录中有76%的文献为英文;在2000年以来的记录中90%的文献为英文;收录国内期刊90余种。,该系统目前出版三种版本: 印刷版: IM(1879年-2005年) 光盘版 : Medline CD-ROM 网络版 : Pubmed: www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed,印刷版: IM,光盘版 : Medline CD-ROM,荷兰语,网络版 : Pubmed,二、CBLARS,CBLARS即China Biomedical Literature Analysis and Retrieval System ,由中国医学科学院医学信息研究所创办的中文医学文献检索系统。,该系统目前出版三种版本: 印刷版:中文科技资料目录(医药卫生)分册 光盘版:中国生物医学文献数据库(CBMDisc) 网络版: 中国生物医学文献服务系统(CBMWEB),光盘版 CBMDisc,网络版 cbmweb,第二节 医学主题词表 Medical Subject Heading (MeSH),一、 主题词表的概念、作用和种类 1主题词表:也称叙词表。 它是将文献标引人员或用户的自然语言转换成规范化名词术语的一种术语控制工具;是概括各门或某一门学科领域,并由语义相关、族性相关的术语组成的规范化的动态词典。,2 医学主题词表的作用: a) 保证主题词的规范化; b) 保证文献作者、标引者和检索者之间用词一致; c) 为检索工具提供主题途径。,3 医学主题词表的种类: 医学主题词表有三种类型: (1)医学主题词注释字顺表: 主题词注释表含有当前词条的详细介绍,包括主题词的中文名、英文名、同义词、相关词、主题词范畴注释、树形结构号、可组配的副主题词、检索回溯注释、标引注释等内容。,(2)轮排表(机读版): 主题词轮排索引是将医学主题词中有实质意义的单词抽取出来按英文字顺排列而成的索引。在每个有实质意义的单词款目下,列举所有含有该单词的主题词及参照词。 例:脓毒性休克,分别列于“toxic shock syndrome”与“shock syndrome,toxic”之下排列。,(3)树状结构表(分类表):(见P42),二、医学主题词注释字顺表的结构和使用 有简表和繁表两种版本: 简表:医学主题词表(Medical Subject Headings,简称MeSH),仅供查找IM的人员使用。 繁表:医学主题词注释字顺表(Medical Subject Headings Annotated Alphabetic List,简称MeSHAAL),供标引人员、编目人员及联机检索人员使用。,(一)收词的数量和种类 主要包括: 1主要叙词(major descriptors):占总收词量的绝大多数。(出版类型、特征词、地理主题词、类目词) 2款目词,也称入口词(entry terms):揭示词间的等同关系。不用于标引。 3次要叙词(Minor Descriptors):1991年停用。 4副主题词:仅起限定主题词的作用,无独立检索意义。可缩小检索范围,提高检准率,(二)收词原则 1选词范围:具有一定使用频率,反映生物医学基本概念和表达特定事物的专有概念、具有独立检索意义的词或词组。按照族性类别分为15大类,可概括为10各方面。 2选定原则: (1)能表达特定事物的专有名词,如机构名、药品名等。 (2)能汇集一定的文献量。 (3)选定的主题词,应概念明确、通用易懂,具有单一性。 (4)必须由专家推荐和审定。 (5)复合主题词。,(三)排检方法 1严格按照英文字母顺序 2主题词前有短横时,先按横线后的字母顺序排,再按横线前的数字或字母排。 3有些复合主题词采用倒置排列法(称倒置词),目的是使某些类似概念的主题词能字面成族,便于选择专指词,也便于族性检索。,以下为中文索引排检方法: 4中文索引中以汉语拼音字顺排 5英文缩写排在最后。如:CPR 6对于中英文混合的主题词,先按中文排,再排英文。 如:Bright病。,(四)主题词的款目结构及其作用* 主题词的款目结构(item structure): 主题词 树状结构编码 注释系统 参照系统,1、主题词的款目结构 Abortion, Induced E4.520.50+ do not use /util except by MeSH definition; for use of an abortifacient here or in ABORTION, CRIMINAL, coord IM with abortifacient agent (IM with no qualif, not /adv eff unless text specifically discusses adverse eff); dont forget also check tags FEMALE EMBRYOTOMY(碎胎术) was heading1963-85 X Embryotomy,主题词(叙词)(descriptors) 见主题词表,2、树状结构编码(tree structure numbers) 也称树状结构号或分类号。 MEDLARS将所收录的主题词分为15个大类, 每类都有一个树状结构号,可以确定其主题词在分类表中的位置。类号后有+号表示该词还有下位类。,3、注释系统(annotated system) 包括3种注释: 标引注释 编目注释 历史注释,(1)标引注释(indexing notes) 是为标引、编目及检索人员提供的指导性说明。 包括以下4种注释: 词义注释 组配注释 标引规则注释 其他注释,1)词义注释(scope notes) 主要对易混淆的概念进行解释。常用简短文字或注释符号表示,通过注释可以了解某词的词义或学科范围。 常见的注释符号有: GEN:仅用于泛指的、概括的、总论性的文章;最好用专指主题词。 例:镇痛药,阿片类(P60) SPEC:仅用于专业或学科;不要用作组配词。 例:解剖学(P60) = :等于或的同义词。 例:栓塞(P415),2)组配注释(cooperation notes) 组配注释是标引注释的主体。 由于MESH词表收词有限,许多复合概念必须采用组配表达,为保证组配的规范化,词表特指定了规范化的组配方法。,常见的组配注释符号有: do not use:不能与其后列出的副主题词组配。 例: 栓塞,羊水 no qualif:不能组配任何副主题词。 例: 事故预防 SPEC qualif: 仅能使用可与专业或学科组配的副主题词(见PI-36)。 例:解剖学(p60) 举例:杂交瘤(p627) (注意分类:不是肿瘤,而是通过激活肿瘤细胞和淋巴细胞而融合的人造细胞。属A11细胞和亚细胞类。仅可组配PI-36副主题词。),A11 qualify:仅能使用可与A11类组配的副主题词。 例:内质网(P425) D25-26 qualif:只能与D25-26类列出的副主题词组配pI-36d。 例:荧光素类(p488) coord with:与其后面给出的主题词组配。 例: 栓塞(p415) + :与组配。例如:足疾病(p495),3)标引规则注释(indexing rule notes) 作用:通过标引规则注释引导标引者使用其他标引工具书,比如:标引手册、技术札记、标引总则、技术通报等。 常用的注释符号有: Manual (Indexing manual):标引手册。如Manual 23.25+ 见标引手册的23章25节及其下位章节。 例:瘘(p485) TN(Tecnology Note):技术札记。如 TN 23 见技术札记第23条。 例:吸收(p4) Policy:标引总则。 例:瘘 Bull: NLM的技术通报。,4)其它注释符号(other notes): IM:通常用作IM词(即主要主题词) 例:加速度(p5) NIM:通常用作NIM词(即非医学索引主题词) 例:吸收测定法,光子(p4) DF:缩写形式。 例:应付及应收帐(p6),(2)编目注释(catalog notes) 是为图书标引所采用的一种注释。仅供图书编目人员使用。 符号:Catalog,(3)历史注释(history notes) 反映主题词的收入年代、出现形式、族性位置及参照系统等的不同变化,便于检索者使用。主要为便于回溯检索而设置的。 历史注释以一个或多个年份为标识。按时间顺序自右向左排列,最左边为最新变化的年份,如果历史有中断,则给出启止年份。,历史注释举例 例1: Cardiac volume(心脏容量)72(68) 解释为:心脏容量1968年作为次要主题词收入词表至71年,72年以主要主题词收入词表至今。 例2:Indans(茚满类)D4类 91(75)63-67 解释: 63-67年以主要主题词收入词表,68-74年未收入词表,75-90年作为次要主题词收入,91年上升为主要主题词至今。,例3:/anatomyhistology /解剖学与组织学 66;used with category A B 1966-74; A,B1-2 B5-6 1975-89;A1-10,A13-14,A16,B1-2 B6 1990 forward 解释:/解剖学与组织学1966年收入本系统,在1966-1974年间可与A和B两类主题词组配。从1975-1989年,可与A类、B1-2及B6等子类目主题词组配;1990年至今可与A1-10,A13-14,A16,B1-2 及B6 等子类目主题词组配。,4参照系统(consider also terms) 作用:揭示主题词间的内在联系,使标引者和检索者能进一步明确主题词间的语义关系,便于更准确地选词。 用代参照 相关参照 属分参照 也许考虑参照,(1)用代参照 作用: 揭示同义关系,将款目词引向主题词。 指引检索者从非主题词找到规范化的主题词,以保证最大限度地查全率。 用代参照的参照符号是“see”(用)“X”(代),,例如:Cancer see Neoplasms (正参照) 表示前面的Cancer不是主题词,see后面的词才是主题词,应当“用”主题词Neoplasms才可查到Cancer的相关文献。 逆参照符号为“X”。 例如:NEOPLASMS X Cancer 此例表示“X”前面的词可“代”后面的词作主题词。,(2)相关参照 参照符号为“See RelatedXR”,用于处理主题词与主题词之间的相关关系。 作用是利用相关主题词扩大检索范围,以提高查全率。 在相关参照中无论正参照还是逆参照,参照符号前后都是主题词。,例如: Family Planning see related Contraception XR Contraception 此例表示“see related”或“XR”前面的词Family Planning (计划生育)和后面的词Contraception(避孕)都是主题词,而且两主题词之间有相关关系,可以用相关主题词进行检索,以扩大检索面。,(3)属分参照(90年以后取消) 参照符号为“see underXU”,用于处理主题词与次要主题词之间的等级关系。 例如: Heart murmurs see under Heart auscultation 心脏杂音 属 心脏听诊,(4)“也许考虑”参照参照 符号是“Consider also terms at” 作用:提高查全率的措施。 例:Liver consider also terms at HEPAT- 提示利用liver为主题词表达形式的用户,还应考虑以HEPAT-为词根表达肝脏方面的一组词。如肝硬化用Liver cirrhosis表示,而肝炎则用Hepatitis表示,以此启发用户发现肝脏这一概念的用词规律。,MeSHAAL款目结构小结,1. 叙词(主题词)(descriptor) 2. 树状结构号(tree structure numbers) 3.注释系统(annotated system): (1)标引注释(indexing notes) a. 词义注释(scope notes):GEN、SPEC、SPEC qualif b.组配注释(cooperation notes): do not use、no qualif c.标引规则注释(indexing rule notes): Manual、TN d.其他注释(other notes): IM、NIM、DF (2)编目注释(catalog notes): Catalog (3)历史注释(history notes) 4.参照系统(consider also terms),(五)MeSHAAL的局限和维护,1医学主题词表的局限 1)有关中医药的主题词很少; 2)有些概念不能通过词表反映 ; 3)某些综合征没有适当的主题词标引; 4)有关一些新技术、新概念的词汇收录较晚; 5)地理主题词不够多 。,2、医学主题词表的维护 1)增补反映新事物、新学科的主题词; 2)增补编表时漏选而又有必要的主题词; 3)增补已选主题词的同义词(款目词); 4)合并或删除使用频率过低的主题词; 5)修正或增补某些主题词的参照项; 6)修改某些存在漏词和矛盾的注释。,第三节 树状结构表 (medical subject headingstree structure),1结构 将所有主题词按学科体系进行族性划分,共分出15个大类,114个亚类。 (见课本P43) 2树状结构表著录格式 (见课本P46),3树状结构表的作用 (1)用树状结构号确定主题词在族系中的位置,是字顺表和树状结构表的联系号。是标引人员选用副主题词组配范围的依据。 例如:“骨质吸收”能否与副主题词/并发症组配? 其树状结构号是:C5(肌肉与骨骼系统疾病)和C11(眼疾病)。作为C5类可组配的副主题词:/血液、/分类、/并发症等35个;但作为C11类仅能与/药物作用和/放射效应组配。,(2)是标引人员和检索人员选择专指性主题词的依据: (3)是选择专指词或上位词的依据。 例如:唇疱疹 上位词是 单纯疱疹 马尾神经 上位词是 周围神经 马尾神经疾病 上位词是 周围神经疾病,(4)可以满足族性检索的要求,实现扩展检索。 如:检索微量元素方面的文献。,(5)通过分类号可以了解某主题词的学科属性及该词与其他词的属分关系,加深对医学知识的了解。 例如: 重链病 C15.604.515.435是一种什么疾病? 淋巴疾病 C15.604.+ 淋巴组织增生性疾病 C15.604.515+,(6)提高联机检索效率 (7)可满足生物医学科学未来进展的长远需要 26个字母中只用了A-N、Z共15个字母作为大类。可满足医学科学进展需要,为MEDLARS每年维护留下余地;中国中医研究院利用空类将中医药学主题词编入T类,其下又分为A、B、C、D等亚类。,4.字顺表与树状结构表的关系 是MeSH的两个主要组成部分,它们之间相对独立,但又互相关联,共同构成一个有机整体。 字顺表按主题词的字母顺序排列主题词,体现主题词之间的横向联系;树状结构表将主题词按学科分类排列,体现了主题词之间的纵向隶属关系。 字顺表与树状结构表的联系是通过树状结构号得以体现的。,新增加的医学主题词树形结构类目(P43),A17 Integumentary system 体被系统 B2 Algae 藻类 G13 Genetic Phenomena 遗传现象 G14 Genetic structures 遗传结构,第四节 在线MeSH表,在线词表提供最新版本词表,每周更新一次,能及时提供新增的MeSH词,反映新的医药概念和术语。 网址:http:/www.nlm.nih.gov/mesh/MBrowser.html,例如:查找“肺癌”的规范主题词形式。,点击进入树状结构,点击显示副主题词,第四章 中医药主题词表,中医药主题词表是由中国中医研究院图书情报研究所编制的。 1987年出第一版,是专门为标引中医方面文献而编写的。 分为七个组成部分:主表、副主题词表、范畴表、附表、简表、索引表和标引手册。 共收录主题词5806个,副主题词11个。,(一)主表,所有主题词按汉语拼音字顺排列。 1、主题词的款目结构: 1)主题词的汉语拼音。 2)主题词名称。 3)主题词英译名。 4)范畴号。 5)注释:包括主题词、使用范围、组配原则、词义注释。 6)参照系统(YDSFC),例如:温病,Wen bing 温病 Seasonal prevalent disease TC25.10.90+ 属伤寒和温病;由温邪引起的以发热为主症,具有热象偏重、易化燥伤阴等特点的一类急性外感热病的总称,仅用于总论,宜用专指词; /诊断考虑卫气营血辨证 。 S 个感病 C 卫气血管辨证,2、款目词(非正式主题词)。 3、类目词:为保证分类体系的完整而设。,(二)范畴表,将主表中的主题词根据学科体系仿照MeSH分类,分15个大类。范畴号和大的类号同MeSH,仅在其前冠以T(Traditional Chinese Medical),由双字母组成。各大类目下列出隶属于该类的全部主题词,呈树状结构。 如:温病 TC25.10.90+,(三)简表,类似MeSH的中文索引。 目的:缩小篇幅,便于查阅。,(四)附表,国际标准化针灸穴位名称。,(五)索引表,1、中医主题词英汉对照索引。 2、中草药及药用植物拉丁名称索引。,(六)副主题词表,将MeSH表中的副主题词和中医药主题词表中的11个副主题词全部列入其中,并有详细的定义和组配规定。 中医药副主题词: /按摩疗法、/气功疗法、/气功效应、/生产和制备、/穴位疗法、/针灸疗法、/针灸效应、/中西医结合疗法、/中药疗法、/中医病机、/中医疗法。,(七)标引手册,说明各类主题词的标引原则,选词方法,其结构类似于MeSH的标引手册。,MEDLARSCBLARS和医学主题词表小结,第一节 MEDLARSCBLARS 第二节 医学主题词表 一、主题词表的概念、作用和种类 二、医学主题词注释字顺表的结构和使用 (一)收词的数量和种类 (二)收词原则 (三)排检方法 (四)*主题词的款目结构及其作用 (五)MeSHAAL的局限和维护 第三节 树状结构表 1结构 2作用,复习思考题,1.每个主题词款目下有几大部分? 2.历史注释的意义是什么? 3.早期肝癌、左手、上肢、胰岛素依赖型糖尿病如何标引? 4.树状结构表的作用有哪些? 5.什么是主题词表?其作用是什么? 6.主题词表收词的种类? 7.主题词表收词的原则? 8.主题词表的著录格式? 9.主题词表的注释系统包括哪几部分?其注释符号分别是什么? 10.主题词表的参照系统有哪些?各自的参照符号是什么? 11.如何使用在线的MeSH表?,医学主题词表实习题,1、查主题词注释表,举例说明下列缩写的意义是什么? GEN IM A11 qualif TN no qualif Manual 23.17 SPEC qualif 2、说明下列主题词的历史沿革: 1)牙周炎 2)Forsman抗原 3)评价研究,3、回答下列问题并解释为什么? 1)耳肿瘤归哪个类?有无下位词? 2)“血小板因子”可能和哪些副主题词组配? 3)解释放射疗法的标引注释? 4、将下列不规范词转换成规范化主题词。 1)进行性系统性硬化; 2)受体阻滞剂; 3)COPD; 4)脑挫伤; 5)Lowe综合症; 6)Conn病; 7)淋球菌。,
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